19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3561 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  400  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  48.22 
 
 
197 aa  228  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  52.06 
 
 
198 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  49.24 
 
 
201 aa  214  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  52.85 
 
 
284 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  32.81 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  41.8 
 
 
327 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  37.19 
 
 
126 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  37.27 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  28.65 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  27.32 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  35.34 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  40.91 
 
 
128 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1211  HNH nuclease  32.31 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2368  HNH nuclease  38.46 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0035  hypothetical protein  22.22 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2089  hypothetical protein  28.23 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160515  normal  0.051607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1618  hypothetical protein  30.08 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0153  hypothetical protein  32.84 
 
 
168 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.012913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>