15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2987 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  60.34 
 
 
181 aa  247  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  31.84 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3960  hypothetical protein  64.06 
 
 
66 aa  92  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0262009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  32.47 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3952  hypothetical protein  75.56 
 
 
46 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.849215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  28.22 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  28.65 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  24.48 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  29.93 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0035  hypothetical protein  29.25 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  38.46 
 
 
284 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  32.43 
 
 
327 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2089  hypothetical protein  23.76 
 
 
231 aa  44.7  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160515  normal  0.051607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>