15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1230 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  31.84 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  33.83 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0035  hypothetical protein  27.67 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  35.45 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  35.34 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  35.92 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  26.79 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  27.44 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  27.8 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2089  hypothetical protein  22.88 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160515  normal  0.051607 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3952  hypothetical protein  45.24 
 
 		 46 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.849215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  29.82 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  25.53 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0756  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  42  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000116599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>