12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2112 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  43.81 
 
 		 200 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  39.02 
 
 		 198 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  37.27 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  39.66 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  36.19 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  38.18 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  45.45 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  35.96 
 
 		 181 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  33.64 
 
 		 181 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>