More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3038 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  43.18 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  39.05 
 
 		 652 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  57.89 
 
 		 648 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  56.67 
 
 		 651 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  50 
 
 		 668 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  41.38 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  44.3 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.83 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.83 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  50 
 
 		 650 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  52.54 
 
 		 644 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  42.11 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  40.74 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  53.7 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  53.7 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  41.18 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.7 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  53.7 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  56.36 
 
 		 652 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  42.17 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.55 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  50.72 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  54.55 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.79 
 
 		 649 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  38.27 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  57.41 
 
 		 654 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  59.26 
 
 		 657 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.05 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  45.45 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.79 
 
 		 649 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50 
 
 		 665 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  38.75 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  56.36 
 
 		 645 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  40.51 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  57.89 
 
 		 660 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  50 
 
 		 665 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.54 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.06 
 
 		 648 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  54.24 
 
 		 653 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  56.6 
 
 		 654 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  50.85 
 
 		 676 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  58.18 
 
 		 657 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5133  ABC transporter related  44.74 
 
 		 640 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  44.29 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50.91 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.15 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  46.77 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  45.71 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  41.18 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  51.92 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  53.57 
 
 		 657 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  40 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  57.41 
 
 		 707 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  49.25 
 
 		 251 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  56 
 
 		 668 aa  60.5  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  57.41 
 
 		 237 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  53.7 
 
 		 682 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  53.7 
 
 		 682 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.27 
 
 		 230 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 		 286 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.7 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  53.7 
 
 		 647 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.7 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  53.7 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  53.57 
 
 		 657 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1339  ATPase  35.85 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.7 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  52.73 
 
 		 647 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  50.91 
 
 		 657 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.3 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  53.7 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.7 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  44.44 
 
 		 715 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.7 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  41.94 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  43.24 
 
 		 656 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.95 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  52.73 
 
 		 656 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  50.91 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  56 
 
 		 655 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  45.9 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  52.63 
 
 		 563 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  52.54 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.57 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>