More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0382 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  65.52 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  65.09 
 
 		 232 aa  304  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  51.82 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  52.97 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.25 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.55 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  45.91 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.21 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  42.73 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  42.73 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  44.8 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.66 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  42.01 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.12 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.12 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.55 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.84 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.29 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  41.78 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.55 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  45.21 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  44.09 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.53 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  43.84 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  38.39 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  38.39 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.47 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  42.47 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  41.7 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  46.08 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.54 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.86 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  42.47 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  39.73 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 649 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.09 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  43.18 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  41.55 
 
 		 678 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.38 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.09 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  44.55 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  41.55 
 
 		 678 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.55 
 
 		 678 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  42.59 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  42.4 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.99 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  44.89 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  44.89 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  43.24 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  39.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.27 
 
 		 642 aa  178  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.56 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.64 
 
 		 642 aa  178  8e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.79 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 		 248 aa  177  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.84 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 250 aa  177  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 254 aa  177  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6494  ABC transporter related  45.37 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  49.25 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  40.89 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  43.38 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  40.18 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.73 
 
 		 293 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.92 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.64 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>