15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0693 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  59.23 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  60.16 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  57.38 
 
 
201 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  45.75 
 
 
200 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  37.1 
 
 
126 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  35.94 
 
 
194 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  36.19 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  38 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  35.92 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  38.46 
 
 
181 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  34.31 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0153  hypothetical protein  39.56 
 
 
168 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.012913  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  43.48 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1618  hypothetical protein  24.54 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>