17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0498 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  54.87 
 
 
198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  53.81 
 
 
197 aa  230  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  49.24 
 
 
200 aa  214  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  57.38 
 
 
284 aa  154  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  32.82 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  32.47 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  38.89 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  78.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  32.43 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  28.72 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2089  hypothetical protein  30.48 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160515  normal  0.051607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  27.8 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1211  HNH nuclease  32.81 
 
 
168 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1618  hypothetical protein  30.56 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2131  HNH nuclease  33.33 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  32.86 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>