15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4283 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  265  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  35.61 
 
 		 198 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  39.09 
 
 		 197 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  37.1 
 
 		 284 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  37.19 
 
 		 200 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  38.89 
 
 		 201 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  38.18 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  32.84 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  25.53 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2089  hypothetical protein  25.98 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160515  normal  0.051607 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0035  hypothetical protein  27.78 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>