15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1551 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  60.34 
 
 		 181 aa  247  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  33.83 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3952  hypothetical protein  75.56 
 
 		 46 aa  74.7  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.849215  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0035  hypothetical protein  26.04 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  27.32 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  28.36 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3960  hypothetical protein  48.39 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0262009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  28.72 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  26.29 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  27.46 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  35.96 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  34.31 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  32.14 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>