20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0908 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  56.63 
 
 
198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  53.81 
 
 
201 aa  230  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  48.22 
 
 
200 aa  228  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  60.16 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  33.68 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  39.09 
 
 
126 aa  88.2  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  36.07 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1211  HNH nuclease  43.08 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  38.18 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2987  hypothetical protein  29.93 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0236546  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1230  hypothetical protein  35.45 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2368  HNH nuclease  47.69 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  26.29 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2131  HNH nuclease  36.23 
 
 
185 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1618  hypothetical protein  31.09 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  40.91 
 
 
128 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2089  hypothetical protein  25.59 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160515  normal  0.051607 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0035  hypothetical protein  22.16 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0153  hypothetical protein  31.88 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.012913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>