33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2368 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2368  HNH nuclease  100 
 
 
166 aa  341  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1211  HNH nuclease  46.99 
 
 
168 aa  167  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2131  HNH nuclease  40.54 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  47.69 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  39.39 
 
 
166 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  38.46 
 
 
200 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  39.62 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  41.51 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  39.62 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  37.29 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  37.93 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  37.5 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  37.25 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  39.53 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  36.92 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  39.66 
 
 
221 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  35.09 
 
 
183 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  37.93 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  36.21 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  35.85 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  33.33 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  42.31 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  28.12 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  33.96 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  36.21 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  31.03 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  31.03 
 
 
182 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  34.04 
 
 
104 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  31.03 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  32 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  36 
 
 
222 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  34 
 
 
178 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  32 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>