More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3246 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3246  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  620  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3175  transcriptional regulator, LysR family  77.85 
 
 		 298 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0801  transcriptional regulator, LysR family  68.49 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1035  transcriptional regulator, LysR family  68.49 
 
 		 299 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3231  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  23.97 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  28.41 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1453  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.248466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  25.49 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  26.74 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.77 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1720  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  23.68 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 293 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1440  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1175  LysR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.852723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1543  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2833  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2815  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1916  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2914  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.298049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1730  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3202  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  23.23 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3260  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.670628  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  29.08 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  25.52 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4069  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3414  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  24.63 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  25.28 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>