More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1175 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1175  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.852723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  24.32 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  22.97 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.4 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.83 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  24.26 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  23.61 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  24.66 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  24.01 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  24.01 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.67 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0801  transcriptional regulator, LysR family  22.61 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  24.67 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4333  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4616  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.67 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  27.08 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.67 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.67 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.67 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  26.22 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.27 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  25.63 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1035  transcriptional regulator, LysR family  22.34 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  21.07 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  22.71 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  24.9 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.27 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1671  LysR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  22.62 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  22.03 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  24.26 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3246  transcriptional regulator, LysR family  20.92 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3175  transcriptional regulator, LysR family  22.11 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.81 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>