More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1656 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1656  LysR family transcriptional regulator  97.97 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.191617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  92.88 
 
 		 297 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 297 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 297 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  91.53 
 
 		 297 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1524  LysR family transcriptional regulator  90.14 
 
 		 297 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2158  LysR family transcriptional regulator  79.39 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0300496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2291  LysR family transcriptional regulator  79.39 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  79.39 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0958  LysR family transcriptional regulator  78.72 
 
 		 297 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2293  LysR family transcriptional regulator  77.97 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  73.29 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  71.28 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  70.39 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  69.07 
 
 		 289 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  68.84 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  68.49 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0351  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.363543  normal  0.665208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0172  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  37.21 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0958  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.181705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0817  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  37.55 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.11 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0434  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1993  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1662  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0852  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0127  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  31.67 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  39.05 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>