235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2354 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  76.98 
 
 
135 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  76.19 
 
 
147 aa  200  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  67.13 
 
 
148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  67.81 
 
 
146 aa  197  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  73.02 
 
 
137 aa  194  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  71.54 
 
 
149 aa  191  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 
154 aa  186  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  61.9 
 
 
147 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  59.85 
 
 
154 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  52.38 
 
 
165 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  47.66 
 
 
154 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  51.37 
 
 
176 aa  133  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  53.28 
 
 
161 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  51.64 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  47.1 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  47.1 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  48.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  47.1 
 
 
159 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  47.1 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  48.41 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
160 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
157 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
144 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
142 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  37.5 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  37.07 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  37.7 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.27 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.45 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  37.86 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.4 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
183 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  29.84 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.13 
 
 
209 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.27 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.5 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
232 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  21.67 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  33.05 
 
 
136 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
139 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.18 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  28.68 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2825  thioesterase superfamily protein  27.18 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249346  normal  0.0935289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>