More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1729 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
249 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 
560 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
252 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 
279 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.1 
 
 
263 aa  145  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
268 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
249 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  33.2 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
280 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
278 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
277 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
278 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
278 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 
256 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
257 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
267 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  36.56 
 
 
244 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
282 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
278 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.22 
 
 
273 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  33.04 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
273 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  33.05 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
283 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
266 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
275 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
265 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
274 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
269 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  27.87 
 
 
275 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
267 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
278 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
278 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  32.34 
 
 
267 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
272 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  29.53 
 
 
278 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
274 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  27.38 
 
 
275 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  30.93 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.83 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02194  putative oxidoreductase protein  28 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415405  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.641211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511377  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  30.54 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.65 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  35.54 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.76 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>