More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1492 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1492  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  50.72 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  60.39 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  49.15 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  48.59 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  51.39 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  51.1 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  46.05 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  51.32 
 
 		 283 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  46.67 
 
 		 389 aa  72  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  36.43 
 
 		 400 aa  72  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  44.74 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  42.5 
 
 		 408 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 360 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 360 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  30.77 
 
 		 732 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  29.59 
 
 		 753 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  39.36 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  40.51 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  41.67 
 
 		 449 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  41.67 
 
 		 449 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.67 
 
 		 450 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  41.67 
 
 		 450 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.67 
 
 		 450 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  41.67 
 
 		 450 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.67 
 
 		 450 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.67 
 
 		 450 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  43.06 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  38.27 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  43.06 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  40.79 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  31.41 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  40.79 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.54 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  38.89 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  37.66 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  36.7 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32.89 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 451 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  37.66 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  30.13 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 451 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  39.51 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.61 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.89 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 547 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 785 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  31.36 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>