More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2731 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2731  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 261 aa  517  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  43.97 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  26.77 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  28.94 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.74 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  26.72 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  41.25 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 120 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  24.59 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.89 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  41.03 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  41.03 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0565  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  35.92 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  35.92 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  23.28 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 123 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 340 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 366 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3708  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  38.68 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>