72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3066 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  100 
 
 		 1027 aa  1967    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1036 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1041 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  38.15 
 
 		 877 aa  315  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  40.83 
 
 		 828 aa  220  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  37.38 
 
 		 914 aa  177  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  28.27 
 
 		 946 aa  172  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  29.44 
 
 		 819 aa  170  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  28.02 
 
 		 1245 aa  164  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  45.23 
 
 		 940 aa  162  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  44.1 
 
 		 933 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  44.56 
 
 		 962 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  27.35 
 
 		 911 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  44.39 
 
 		 969 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  44.39 
 
 		 968 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  34.96 
 
 		 883 aa  148  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  35.38 
 
 		 279 aa  144  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  44.97 
 
 		 918 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  46.84 
 
 		 885 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  48.11 
 
 		 938 aa  141  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  31.34 
 
 		 927 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30.33 
 
 		 924 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  35.1 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  37.4 
 
 		 826 aa  137  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  48.89 
 
 		 964 aa  137  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  44.02 
 
 		 889 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  51.61 
 
 		 870 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  26.74 
 
 		 896 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  42.11 
 
 		 959 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  33.25 
 
 		 640 aa  125  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  45.99 
 
 		 673 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  29.16 
 
 		 1057 aa  119  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  34.78 
 
 		 679 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  33.42 
 
 		 658 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  30.83 
 
 		 948 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  31.03 
 
 		 947 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  26.93 
 
 		 822 aa  115  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  29.41 
 
 		 931 aa  110  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  27.64 
 
 		 897 aa  107  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  42.42 
 
 		 952 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  34.8 
 
 		 722 aa  97.8  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.8 
 
 		 731 aa  97.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  32.44 
 
 		 737 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  32.75 
 
 		 717 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  32.42 
 
 		 870 aa  95.5  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  35.58 
 
 		 692 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.08 
 
 		 458 aa  94  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  29.82 
 
 		 715 aa  94.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  38.52 
 
 		 595 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  33.05 
 
 		 681 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.91 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  30.8 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.19 
 
 		 744 aa  77  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  38.82 
 
 		 640 aa  69.7  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 883 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  58.33 
 
 		 888 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 912 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  32.61 
 
 		 911 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  33.08 
 
 		 633 aa  49.7  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  39.33 
 
 		 685 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  41.67 
 
 		 752 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  45.61 
 
 		 392 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1273 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  27.63 
 
 		 945 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  33.65 
 
 		 2764 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1482 aa  46.2  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1135 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  38.2 
 
 		 694 aa  45.8  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 802 aa  45.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  44.19 
 
 		 1454 aa  45.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1948  hypothetical protein  28.09 
 
 		 637 aa  44.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.145014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>