More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3202 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.27 
 
 		 2300 aa  1151    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  47.56 
 
 		 2771 aa  2339    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  64.41 
 
 		 2531 aa  2027    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  43.29 
 
 		 1764 aa  1176    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 		 1272 aa  1046    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  79.12 
 
 		 2683 aa  2836    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  100 
 
 		 2764 aa  5648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  68.69 
 
 		 2703 aa  2397    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.7 
 
 		 2414 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  43.49 
 
 		 2560 aa  787    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.58 
 
 		 2260 aa  868    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  68.75 
 
 		 2694 aa  2397    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  70.19 
 
 		 2664 aa  2437    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.71 
 
 		 2443 aa  713    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.09 
 
 		 2477 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  39.78 
 
 		 2298 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  63.56 
 
 		 2657 aa  2177    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  64.26 
 
 		 2640 aa  2130    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  68.06 
 
 		 2620 aa  2358    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  32.07 
 
 		 2674 aa  685    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  64.25 
 
 		 2624 aa  2141    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 		 2266 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  41.72 
 
 		 2338 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  55.73 
 
 		 2542 aa  1803    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.52 
 
 		 1772 aa  1167    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  67.63 
 
 		 2642 aa  2220    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  46.98 
 
 		 2661 aa  2243    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.16 
 
 		 2249 aa  981    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  68.35 
 
 		 2704 aa  2392    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  84.56 
 
 		 2750 aa  4655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42 
 
 		 1845 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  69.49 
 
 		 2693 aa  2409    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  43.56 
 
 		 2189 aa  690    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  45.19 
 
 		 2448 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  63.55 
 
 		 2619 aa  1753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  40.9 
 
 		 2553 aa  632  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  37.82 
 
 		 2503 aa  557  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  37.1 
 
 		 2327 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  36.74 
 
 		 2314 aa  533  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  37.13 
 
 		 2386 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  34.4 
 
 		 3008 aa  512  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 2628 aa  506  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2772 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.6 
 
 		 3243 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.96 
 
 		 1631 aa  486  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  35.89 
 
 		 2816 aa  483  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.72 
 
 		 2754 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  33.37 
 
 		 2888 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.28 
 
 		 2462 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.44 
 
 		 1656 aa  383  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.12 
 
 		 1453 aa  383  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 		 2551 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 1874 aa  377  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  32.55 
 
 		 2614 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.04 
 
 		 1480 aa  367  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 		 4478 aa  364  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.86 
 
 		 3696 aa  363  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.61 
 
 		 3099 aa  359  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.65 
 
 		 2551 aa  357  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.1 
 
 		 1337 aa  357  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  31.27 
 
 		 1929 aa  355  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  31.41 
 
 		 1923 aa  352  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  42.25 
 
 		 3115 aa  352  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  30.93 
 
 		 4080 aa  350  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.87 
 
 		 7210 aa  348  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  31.53 
 
 		 1935 aa  347  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 		 7110 aa  345  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  29.52 
 
 		 3676 aa  343  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.48 
 
 		 3693 aa  340  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.48 
 
 		 3693 aa  340  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  29.59 
 
 		 3702 aa  340  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29.54 
 
 		 1587 aa  339  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  30.48 
 
 		 1985 aa  338  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.65 
 
 		 1087 aa  337  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.2 
 
 		 1354 aa  337  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  29.88 
 
 		 1548 aa  336  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  29.62 
 
 		 1646 aa  335  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  30.41 
 
 		 2176 aa  335  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.02 
 
 		 1909 aa  334  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 5400 aa  334  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  28.44 
 
 		 1574 aa  333  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.33 
 
 		 1349 aa  333  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.57 
 
 		 1372 aa  331  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.59 
 
 		 950 aa  331  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  30.58 
 
 		 1934 aa  330  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.07 
 
 		 1349 aa  330  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 2374 aa  330  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 1816 aa  331  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 2376 aa  330  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  30.8 
 
 		 1908 aa  330  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 		 3092 aa  329  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  30.45 
 
 		 3494 aa  328  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  29.65 
 
 		 3711 aa  328  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  30.34 
 
 		 3176 aa  327  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  29.76 
 
 		 1144 aa  327  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 		 3254 aa  326  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  29.78 
 
 		 2020 aa  325  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  29.91 
 
 		 3679 aa  325  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4749  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 584 aa  325  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.792505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  31.22 
 
 		 1535 aa  323  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>