More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3472 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  44.19 
 
 
1733 aa  1032    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  55.73 
 
 
1453 aa  1434    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  50.88 
 
 
1740 aa  805    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1480 aa  2925    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 
1413 aa  941    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.91 
 
 
1631 aa  483  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
1272 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.9 
 
 
1772 aa  425  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  33.69 
 
 
2298 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  32.57 
 
 
1764 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  35.71 
 
 
2560 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 
2664 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 
2620 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  31.7 
 
 
2619 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.79 
 
 
2704 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.34 
 
 
2477 aa  387  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  31.69 
 
 
3115 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.66 
 
 
2694 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  30.74 
 
 
2703 aa  384  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  30.66 
 
 
2693 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.13 
 
 
2327 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.3 
 
 
2443 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.87 
 
 
2249 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  30.04 
 
 
2683 aa  379  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  30.27 
 
 
2764 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  30.47 
 
 
2531 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  34 
 
 
2448 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  32.97 
 
 
2553 aa  370  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.44 
 
 
2414 aa  370  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  30.7 
 
 
2542 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.56 
 
 
2189 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  30.63 
 
 
2657 aa  366  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  33.37 
 
 
2266 aa  365  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.64 
 
 
2628 aa  365  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.65 
 
 
2260 aa  362  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  30.36 
 
 
2640 aa  362  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  30.25 
 
 
2624 aa  361  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  28.38 
 
 
3008 aa  357  1e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.04 
 
 
2300 aa  351  6e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 
2816 aa  339  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  44.86 
 
 
2674 aa  330  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  45.15 
 
 
2386 aa  329  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.18 
 
 
3099 aa  328  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.76 
 
 
2661 aa  325  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  44.75 
 
 
2338 aa  322  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  42.15 
 
 
3243 aa  319  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  45.28 
 
 
2314 aa  319  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  41.01 
 
 
2642 aa  318  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.63 
 
 
2750 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.76 
 
 
1656 aa  313  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  28.38 
 
 
2126 aa  311  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.21 
 
 
2771 aa  310  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  31.14 
 
 
3080 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.64 
 
 
1939 aa  310  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27.41 
 
 
2551 aa  310  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 
3696 aa  307  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.89 
 
 
4478 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.09 
 
 
3693 aa  306  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.09 
 
 
3693 aa  306  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.16 
 
 
3676 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
2551 aa  305  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  31.92 
 
 
1795 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.98 
 
 
1087 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.65 
 
 
1845 aa  302  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.88 
 
 
3702 aa  303  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  27.72 
 
 
1587 aa  301  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.68 
 
 
7210 aa  301  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  31.93 
 
 
1548 aa  301  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 
5154 aa  300  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.54 
 
 
950 aa  298  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  28.32 
 
 
1646 aa  297  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  45.42 
 
 
2503 aa  297  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 
1828 aa  297  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.7 
 
 
2762 aa  294  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
4101 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  30.55 
 
 
1470 aa  294  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  31.8 
 
 
2454 aa  294  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  26.67 
 
 
2754 aa  293  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  31.43 
 
 
2085 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  31.43 
 
 
2085 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  30.73 
 
 
2232 aa  290  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
1874 aa  290  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  30.71 
 
 
2108 aa  289  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  31.43 
 
 
2085 aa  290  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
1816 aa  288  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  31.17 
 
 
2477 aa  288  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  30.51 
 
 
2682 aa  287  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  29.19 
 
 
2710 aa  287  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 
1805 aa  287  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  30.74 
 
 
3101 aa  286  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  28.57 
 
 
4111 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 
2684 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  29.33 
 
 
1658 aa  286  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  30.03 
 
 
1489 aa  286  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  26.18 
 
 
1559 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.51 
 
 
1337 aa  285  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  33.26 
 
 
4575 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  26.62 
 
 
1354 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  38.21 
 
 
2772 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  25.95 
 
 
1559 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>