More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2907 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  53.18 
 
 
2771 aa  1757    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  63.34 
 
 
2531 aa  2046    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.47 
 
 
2249 aa  918    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  42.81 
 
 
1764 aa  1158    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  42.98 
 
 
1272 aa  1019    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  65.34 
 
 
2704 aa  3377    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  42.64 
 
 
2560 aa  775    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.1 
 
 
2260 aa  877    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.91 
 
 
2414 aa  646    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  64.78 
 
 
2664 aa  3346    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  100 
 
 
2683 aa  5509    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  61.2 
 
 
2657 aa  3102    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  61.01 
 
 
2640 aa  3052    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  62.87 
 
 
2620 aa  3233    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.24 
 
 
2443 aa  707    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  78.98 
 
 
2750 aa  2868    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  61.38 
 
 
2624 aa  3076    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  37.69 
 
 
2266 aa  919    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  44.63 
 
 
2448 aa  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  52.06 
 
 
2542 aa  2481    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.16 
 
 
2338 aa  742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  38.52 
 
 
2298 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  45.27 
 
 
2661 aa  2119    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.58 
 
 
2674 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.48 
 
 
1772 aa  1175    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.9 
 
 
2477 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  65.91 
 
 
2693 aa  3390    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  64.92 
 
 
2703 aa  3365    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  79.33 
 
 
2764 aa  2857    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  68.07 
 
 
2642 aa  2255    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  65.63 
 
 
2694 aa  3378    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  66.48 
 
 
2619 aa  3407    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.52 
 
 
2300 aa  1147    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  41.12 
 
 
2189 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.71 
 
 
1845 aa  635  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  39.19 
 
 
2553 aa  633  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  38.9 
 
 
2503 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  36.65 
 
 
2327 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  36.84 
 
 
2386 aa  536  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  36.28 
 
 
2314 aa  523  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
2628 aa  513  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  34.29 
 
 
3008 aa  511  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 
2772 aa  497  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 
3243 aa  497  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.64 
 
 
1631 aa  489  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  34.95 
 
 
2816 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 
3115 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.67 
 
 
2754 aa  393  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  32.7 
 
 
2888 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31 
 
 
1656 aa  383  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.88 
 
 
2462 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 
2614 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.01 
 
 
1453 aa  377  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
1874 aa  373  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
2551 aa  371  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  31.73 
 
 
4478 aa  370  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  32.85 
 
 
1923 aa  368  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.53 
 
 
2551 aa  364  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  30.88 
 
 
1733 aa  363  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  31.13 
 
 
1929 aa  357  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 
3696 aa  357  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.5 
 
 
3099 aa  355  8e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  31.44 
 
 
1985 aa  354  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.38 
 
 
1337 aa  353  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  30.88 
 
 
1935 aa  349  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  30.21 
 
 
1548 aa  347  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.44 
 
 
7210 aa  346  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  29.52 
 
 
3676 aa  344  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  31.15 
 
 
1934 aa  343  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  29.88 
 
 
1413 aa  343  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  29.93 
 
 
1646 aa  342  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  29.23 
 
 
1087 aa  341  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  30.79 
 
 
4080 aa  340  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.7 
 
 
1349 aa  339  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.12 
 
 
1909 aa  339  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
7110 aa  339  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.8 
 
 
1372 aa  339  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.49 
 
 
1349 aa  338  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  30.87 
 
 
1908 aa  338  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.81 
 
 
950 aa  337  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  29.13 
 
 
1559 aa  330  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  28.92 
 
 
3254 aa  330  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4749  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
584 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.792505  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.9 
 
 
1559 aa  327  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  30.71 
 
 
2273 aa  327  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29 
 
 
1587 aa  327  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.66 
 
 
1354 aa  327  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  30.18 
 
 
2374 aa  326  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  29.68 
 
 
3679 aa  326  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.74 
 
 
2376 aa  325  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 
3693 aa  326  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 
3693 aa  326  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 
3702 aa  325  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  29.27 
 
 
1574 aa  325  9.000000000000001e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
3092 aa  324  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
5400 aa  324  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  28.85 
 
 
2477 aa  323  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  29.09 
 
 
2604 aa  322  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  29.01 
 
 
3176 aa  320  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.86 
 
 
1984 aa  320  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>