More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1453 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  53.99 
 
 
2771 aa  1765    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  69.83 
 
 
2750 aa  2409    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  71.46 
 
 
2531 aa  2271    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  43.94 
 
 
1764 aa  1172    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.63 
 
 
2300 aa  1145    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.56 
 
 
2443 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  43.19 
 
 
1272 aa  1061    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  69.04 
 
 
2764 aa  2370    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  42.57 
 
 
2560 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.91 
 
 
2260 aa  906    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.69 
 
 
2477 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  64.02 
 
 
2664 aa  3377    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  95.15 
 
 
2703 aa  5177    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.78 
 
 
1845 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  69.33 
 
 
2657 aa  3620    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  70.05 
 
 
2640 aa  3568    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  65.43 
 
 
2620 aa  3387    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  69.96 
 
 
2624 aa  3585    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  95.01 
 
 
2704 aa  5095    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  41.35 
 
 
2266 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  42.51 
 
 
2189 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  52.43 
 
 
2542 aa  2499    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  100 
 
 
2694 aa  5510    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  51.99 
 
 
2661 aa  1728    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.4 
 
 
1772 aa  1191    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.21 
 
 
2338 aa  740    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  95.06 
 
 
2693 aa  5120    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  64.09 
 
 
2619 aa  3273    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  44.8 
 
 
2448 aa  792    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.06 
 
 
2414 aa  655    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  65.75 
 
 
2683 aa  3334    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  90.62 
 
 
2642 aa  3062    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  41.32 
 
 
2298 aa  721    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.48 
 
 
2249 aa  704    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  39.78 
 
 
2553 aa  613  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  38.42 
 
 
2674 aa  590  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  38.12 
 
 
2503 aa  559  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  37.04 
 
 
2327 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  37.53 
 
 
2386 aa  533  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  35.33 
 
 
2314 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.7 
 
 
2628 aa  509  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  33.27 
 
 
3008 aa  503  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 
3115 aa  503  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  32.62 
 
 
2772 aa  500  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.34 
 
 
1631 aa  487  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  35.7 
 
 
2816 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  30.69 
 
 
2754 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.12 
 
 
1656 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
2551 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  30.21 
 
 
2462 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  31.57 
 
 
1453 aa  381  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  32.08 
 
 
2888 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
1874 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 
3696 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  29.62 
 
 
1087 aa  365  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 
4478 aa  365  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.48 
 
 
3099 aa  362  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  31.13 
 
 
4080 aa  362  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
3243 aa  361  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  30.94 
 
 
2614 aa  361  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  30.7 
 
 
1413 aa  360  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.13 
 
 
2551 aa  360  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30.19 
 
 
1646 aa  358  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29.89 
 
 
1587 aa  356  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.16 
 
 
3702 aa  354  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  27.96 
 
 
1354 aa  352  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.49 
 
 
1349 aa  352  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.28 
 
 
1349 aa  351  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.88 
 
 
1337 aa  351  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.93 
 
 
3693 aa  350  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.93 
 
 
3693 aa  350  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  30.32 
 
 
1923 aa  348  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.38 
 
 
1909 aa  346  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  29.57 
 
 
3676 aa  345  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  31.27 
 
 
2376 aa  343  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
1816 aa  343  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.59 
 
 
7210 aa  342  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  30.1 
 
 
4186 aa  342  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.98 
 
 
950 aa  342  8e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  29.37 
 
 
1548 aa  341  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.8 
 
 
2762 aa  341  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.18 
 
 
1372 aa  341  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  30.53 
 
 
2374 aa  341  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  30.98 
 
 
1908 aa  341  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  30.82 
 
 
2604 aa  339  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  29.25 
 
 
1574 aa  338  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.5 
 
 
1101 aa  337  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  28.59 
 
 
3252 aa  337  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  29.7 
 
 
4840 aa  337  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  30.55 
 
 
1929 aa  337  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  29.86 
 
 
3679 aa  336  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  29.73 
 
 
3254 aa  335  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
5154 aa  335  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  29.18 
 
 
1559 aa  335  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.96 
 
 
1559 aa  333  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  29.42 
 
 
2333 aa  333  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  29.82 
 
 
2113 aa  331  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  30.35 
 
 
1985 aa  331  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  30.58 
 
 
2880 aa  330  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  29.62 
 
 
2985 aa  330  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>