More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2267 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.48 
 
 
2694 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.82 
 
 
2771 aa  970    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.34 
 
 
2704 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 
1764 aa  752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 
1272 aa  860    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  41.6 
 
 
2338 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  40.84 
 
 
2642 aa  700    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  37.77 
 
 
2764 aa  994    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  42.11 
 
 
2560 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  40.31 
 
 
2260 aa  993    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 
2664 aa  1021    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.55 
 
 
1772 aa  770    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  45.61 
 
 
2189 aa  1100    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 
2657 aa  685    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 
2640 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 
2620 aa  1042    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 
2624 aa  986    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  62.78 
 
 
2266 aa  2748    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  40.63 
 
 
2683 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  42.05 
 
 
2542 aa  695    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.38 
 
 
2661 aa  947    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  61.93 
 
 
2443 aa  1697    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  46.15 
 
 
1845 aa  761    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  34.35 
 
 
2674 aa  653    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  53.7 
 
 
2414 aa  985    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  100 
 
 
2249 aa  4543    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  41.29 
 
 
2703 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  41.38 
 
 
2693 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  63.33 
 
 
2298 aa  2898    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.39 
 
 
2750 aa  984    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  34.89 
 
 
2327 aa  644    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  36.31 
 
 
2503 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  42.18 
 
 
2619 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.49 
 
 
2300 aa  783    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  58.47 
 
 
2477 aa  1321    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  43.13 
 
 
2448 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  33.58 
 
 
2531 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  38.79 
 
 
2386 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  41.32 
 
 
2553 aa  619  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  37.29 
 
 
2314 aa  615  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  40.8 
 
 
2628 aa  546  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 
2816 aa  542  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  35.02 
 
 
3008 aa  530  1e-148  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  35.53 
 
 
2772 aa  500  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.84 
 
 
1631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.93 
 
 
2754 aa  432  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 
1656 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  32.7 
 
 
1923 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  33.05 
 
 
2614 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.92 
 
 
1984 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 
1453 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  29.96 
 
 
1087 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  33.78 
 
 
2888 aa  374  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  33.3 
 
 
1935 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 
1413 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 
2462 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 
1144 aa  370  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  32.34 
 
 
1480 aa  366  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  33.04 
 
 
1929 aa  364  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30 
 
 
1587 aa  364  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 
2232 aa  363  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  33.3 
 
 
1985 aa  363  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.38 
 
 
4478 aa  362  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  32.71 
 
 
1733 aa  359  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  33.86 
 
 
1934 aa  359  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  32.61 
 
 
1740 aa  358  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 
1354 aa  356  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 
3702 aa  352  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.2 
 
 
1372 aa  352  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  42.55 
 
 
3243 aa  350  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  30.79 
 
 
3693 aa  350  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  30.79 
 
 
3693 aa  350  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.58 
 
 
1337 aa  348  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.1 
 
 
2551 aa  348  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  30.58 
 
 
1349 aa  346  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
2551 aa  345  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  41.42 
 
 
3115 aa  345  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.48 
 
 
1349 aa  345  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  31.74 
 
 
2225 aa  344  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
5154 aa  343  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  30.07 
 
 
1908 aa  343  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 
3696 aa  340  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  30.93 
 
 
1574 aa  340  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  29.36 
 
 
1424 aa  339  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.55 
 
 
2880 aa  339  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 
1874 aa  338  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.02 
 
 
3427 aa  338  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.54 
 
 
950 aa  337  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
3092 aa  336  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.46 
 
 
3676 aa  336  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.53 
 
 
3099 aa  336  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.07 
 
 
2374 aa  335  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  29.66 
 
 
1408 aa  334  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.44 
 
 
7210 aa  334  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  30.07 
 
 
7279 aa  333  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
1816 aa  333  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  31.71 
 
 
2367 aa  333  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.49 
 
 
1909 aa  333  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  30.62 
 
 
3679 aa  332  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  32.1 
 
 
3494 aa  330  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>