More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0927 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  65.43 
 
 		 1733 aa  1207    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1740 aa  3370    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  51.69 
 
 		 1480 aa  826    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1413 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  52.58 
 
 		 1453 aa  850    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.23 
 
 		 1631 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  32.25 
 
 		 1272 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.95 
 
 		 1772 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.37 
 
 		 2661 aa  399  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  31.31 
 
 		 1764 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.99 
 
 		 2477 aa  394  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.73 
 
 		 2300 aa  393  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.44 
 
 		 2674 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  30.09 
 
 		 2642 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.1 
 
 		 2664 aa  383  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.26 
 
 		 2704 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.23 
 
 		 2249 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  31.26 
 
 		 2620 aa  380  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  30.04 
 
 		 2693 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.1 
 
 		 2694 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  32.48 
 
 		 2298 aa  380  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  31.1 
 
 		 2619 aa  377  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  35.93 
 
 		 2503 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.33 
 
 		 2771 aa  374  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  30.61 
 
 		 2683 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  29.68 
 
 		 2703 aa  374  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.84 
 
 		 2443 aa  374  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  30.09 
 
 		 2531 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  29.91 
 
 		 2657 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  29.81 
 
 		 2640 aa  367  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 		 3243 aa  366  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 		 2560 aa  365  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  31.39 
 
 		 2764 aa  359  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  35.73 
 
 		 2386 aa  358  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  32.62 
 
 		 2553 aa  357  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  32.3 
 
 		 3115 aa  356  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 		 2628 aa  355  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  30.68 
 
 		 2327 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  29.09 
 
 		 3008 aa  346  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.58 
 
 		 2260 aa  344  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  31.04 
 
 		 2542 aa  343  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  32.81 
 
 		 2266 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.56 
 
 		 1845 aa  342  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  31.68 
 
 		 2448 aa  338  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  34.4 
 
 		 2816 aa  336  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.16 
 
 		 2750 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  41.46 
 
 		 2189 aa  318  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.98 
 
 		 2414 aa  317  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 		 2624 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  42.11 
 
 		 2314 aa  308  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  41.29 
 
 		 2338 aa  307  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.19 
 
 		 4478 aa  298  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.5 
 
 		 3099 aa  292  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.74 
 
 		 3676 aa  292  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.01 
 
 		 1656 aa  286  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  28.37 
 
 		 2462 aa  285  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 2551 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  30.45 
 
 		 3679 aa  281  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  26.19 
 
 		 2754 aa  281  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  30.19 
 
 		 2604 aa  279  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  31.26 
 
 		 2880 aa  279  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  30.48 
 
 		 3693 aa  278  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  30.48 
 
 		 3693 aa  278  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  26.47 
 
 		 2551 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.31 
 
 		 3696 aa  276  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  30.99 
 
 		 1795 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  31.42 
 
 		 1934 aa  275  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  27.82 
 
 		 1349 aa  274  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  26.51 
 
 		 1087 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.26 
 
 		 1349 aa  272  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.73 
 
 		 1984 aa  271  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.79 
 
 		 1337 aa  271  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  27.37 
 
 		 1909 aa  268  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  27.57 
 
 		 1354 aa  268  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.95 
 
 		 7210 aa  267  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.44 
 
 		 7110 aa  265  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 		 2772 aa  264  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  27.99 
 
 		 1646 aa  263  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 1951 aa  262  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  28.16 
 
 		 1587 aa  260  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 2374 aa  259  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  26.83 
 
 		 3130 aa  258  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.57 
 
 		 1832 aa  257  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 1816 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.07 
 
 		 3702 aa  255  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  29.01 
 
 		 4111 aa  255  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  29.88 
 
 		 2085 aa  255  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 2085 aa  255  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  30.89 
 
 		 1935 aa  254  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 2085 aa  254  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 		 1874 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.57 
 
 		 1126 aa  253  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.03 
 
 		 1804 aa  253  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  29.49 
 
 		 2498 aa  250  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  29.09 
 
 		 1470 aa  251  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  28.81 
 
 		 2232 aa  249  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  33.86 
 
 		 1696 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  29.94 
 
 		 1835 aa  248  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 		 1923 aa  247  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 3092 aa  247  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>