More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1962 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  100 
 
 		 1631 aa  3242    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 		 1413 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 		 1453 aa  571  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  35.65 
 
 		 1272 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 		 1764 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.51 
 
 		 2300 aa  515  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  39.46 
 
 		 2503 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.84 
 
 		 1772 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  35.48 
 
 		 2674 aa  506  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 		 2620 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 		 2619 aa  503  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  35.57 
 
 		 2664 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  35.24 
 
 		 2189 aa  493  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.52 
 
 		 2704 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.89 
 
 		 2750 aa  493  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  35.44 
 
 		 2693 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  35.29 
 
 		 2642 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  35.47 
 
 		 2531 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  35.71 
 
 		 2640 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  35.3 
 
 		 2703 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  35.53 
 
 		 2683 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.34 
 
 		 2694 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  35.96 
 
 		 2764 aa  485  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.12 
 
 		 2249 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  35.64 
 
 		 2298 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 		 2657 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  35.44 
 
 		 2624 aa  479  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.72 
 
 		 2477 aa  476  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.83 
 
 		 2661 aa  475  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  35.93 
 
 		 2542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  36.58 
 
 		 2553 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  35.97 
 
 		 1740 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.26 
 
 		 2260 aa  469  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.73 
 
 		 2771 aa  465  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.12 
 
 		 2443 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  35.91 
 
 		 1480 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  32.29 
 
 		 3008 aa  456  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  36.5 
 
 		 2448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  35.81 
 
 		 2628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.61 
 
 		 2327 aa  453  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  34.05 
 
 		 2314 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.9 
 
 		 2560 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 		 1733 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  35.75 
 
 		 2816 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  33.51 
 
 		 3243 aa  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.23 
 
 		 2414 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 		 2772 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 		 3115 aa  422  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 		 2266 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.41 
 
 		 1845 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  36.71 
 
 		 2386 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  35.23 
 
 		 2338 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  34.64 
 
 		 1959 aa  357  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  30.04 
 
 		 2754 aa  353  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  28.15 
 
 		 2551 aa  335  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.06 
 
 		 3099 aa  334  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  29.69 
 
 		 1646 aa  331  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 		 1656 aa  331  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.74 
 
 		 1372 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.79 
 
 		 950 aa  327  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 1874 aa  325  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  31.74 
 
 		 2225 aa  325  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.74 
 
 		 1101 aa  324  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  32.5 
 
 		 1795 aa  323  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  32.75 
 
 		 7210 aa  323  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.68 
 
 		 4111 aa  322  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.39 
 
 		 1909 aa  320  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  32.23 
 
 		 4080 aa  318  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  27.89 
 
 		 1354 aa  318  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 		 1832 aa  317  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 		 2614 aa  315  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.51 
 
 		 1349 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  28.62 
 
 		 1349 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  28.7 
 
 		 2462 aa  315  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  32.07 
 
 		 3463 aa  315  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 		 1955 aa  314  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 7110 aa  314  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  31.31 
 
 		 1805 aa  314  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  32.93 
 
 		 1934 aa  313  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.83 
 
 		 1837 aa  313  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.09 
 
 		 1087 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  31.22 
 
 		 3254 aa  310  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  31.86 
 
 		 4840 aa  310  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  30.48 
 
 		 3930 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  30.17 
 
 		 3508 aa  310  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 		 1806 aa  306  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  30.46 
 
 		 1966 aa  306  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  29.61 
 
 		 1653 aa  304  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 3092 aa  304  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  29.38 
 
 		 2719 aa  304  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  30.18 
 
 		 2679 aa  303  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  30.69 
 
 		 3449 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.25 
 
 		 5400 aa  303  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  31.16 
 
 		 4478 aa  303  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.67 
 
 		 3696 aa  303  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  29.7 
 
 		 2230 aa  302  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  30.59 
 
 		 1535 aa  302  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  29.82 
 
 		 3090 aa  301  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  29.69 
 
 		 1424 aa  301  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  31.21 
 
 		 3335 aa  301  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>