More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0462 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.2 
 
 		 2704 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.91 
 
 		 2771 aa  889    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  35.99 
 
 		 2531 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  53.7 
 
 		 2249 aa  1008    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  41.86 
 
 		 2448 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 		 1764 aa  843    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  39.42 
 
 		 1272 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  55.49 
 
 		 2443 aa  1012    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 		 2560 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  35.58 
 
 		 2260 aa  1198    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 		 2664 aa  908    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.83 
 
 		 1772 aa  853    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  36.38 
 
 		 2703 aa  899    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  45.28 
 
 		 1845 aa  724    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  36.04 
 
 		 2657 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  39.79 
 
 		 2640 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  37.4 
 
 		 2620 aa  889    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 		 2624 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 2266 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  37.06 
 
 		 2542 aa  866    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.06 
 
 		 2694 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  47.94 
 
 		 2189 aa  891    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  40.08 
 
 		 2338 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.89 
 
 		 2661 aa  891    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  55.32 
 
 		 2477 aa  1024    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  34.87 
 
 		 2674 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  54.75 
 
 		 2298 aa  1054    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.01 
 
 		 2300 aa  750    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 		 2693 aa  892    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  39.7 
 
 		 2764 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  36.77 
 
 		 2642 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.87 
 
 		 2750 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  39.28 
 
 		 2683 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  41.74 
 
 		 2619 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  100 
 
 		 2414 aa  4908    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  41.46 
 
 		 2503 aa  614  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  39.82 
 
 		 2553 aa  597  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  36.88 
 
 		 2327 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  40.04 
 
 		 2314 aa  580  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  41.6 
 
 		 2386 aa  580  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 		 2628 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 2816 aa  559  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  32.65 
 
 		 3008 aa  503  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.37 
 
 		 2772 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  34.23 
 
 		 1631 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.49 
 
 		 2754 aa  433  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 		 4478 aa  400  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  35.13 
 
 		 2888 aa  397  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.34 
 
 		 1656 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  30.23 
 
 		 1087 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 		 3679 aa  393  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 		 2462 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 		 3696 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.27 
 
 		 1984 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  33.77 
 
 		 2614 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33 
 
 		 1453 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 		 3693 aa  377  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.99 
 
 		 2551 aa  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 		 3693 aa  377  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.46 
 
 		 3099 aa  377  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  31.52 
 
 		 1349 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  33.11 
 
 		 1935 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.52 
 
 		 1349 aa  374  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.27 
 
 		 3676 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.65 
 
 		 3702 aa  374  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 2551 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 1874 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 		 1587 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  33.44 
 
 		 1929 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  30.84 
 
 		 1354 aa  370  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  32.9 
 
 		 1934 aa  370  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 		 7279 aa  367  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 1816 aa  367  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.77 
 
 		 1101 aa  360  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.88 
 
 		 4111 aa  360  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.08 
 
 		 1337 aa  359  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  30.97 
 
 		 1413 aa  358  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 7110 aa  358  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.01 
 
 		 2376 aa  354  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  31.83 
 
 		 4151 aa  353  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 		 1923 aa  352  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  32.37 
 
 		 3194 aa  352  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  31.84 
 
 		 3463 aa  350  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  31.5 
 
 		 4101 aa  350  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  31.38 
 
 		 1480 aa  349  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 3092 aa  350  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  32.75 
 
 		 2966 aa  347  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 		 7210 aa  347  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.96 
 
 		 1909 aa  345  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  32.11 
 
 		 1959 aa  345  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 2374 aa  345  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.19 
 
 		 1985 aa  345  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  30.75 
 
 		 1144 aa  344  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  31.78 
 
 		 3711 aa  344  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  28.96 
 
 		 1559 aa  344  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 		 1548 aa  344  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.8 
 
 		 3427 aa  343  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  32.07 
 
 		 3033 aa  343  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  31.33 
 
 		 4080 aa  342  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 		 3254 aa  342  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>