More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2012 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.86 
 
 
2771 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  35.41 
 
 
2531 aa  1311    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.32 
 
 
2694 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  68.47 
 
 
2443 aa  1916    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  41.03 
 
 
1764 aa  763    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  40.42 
 
 
1272 aa  886    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  54.75 
 
 
2414 aa  1021    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.53 
 
 
2750 aa  1062    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  35.08 
 
 
2327 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  43.22 
 
 
2560 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  41.56 
 
 
2260 aa  1018    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  41.04 
 
 
2664 aa  1077    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  36.97 
 
 
2503 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  35.79 
 
 
2674 aa  703    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  41.22 
 
 
2703 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  46.97 
 
 
2189 aa  1164    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  39.08 
 
 
2657 aa  1019    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  41.32 
 
 
2640 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 
2620 aa  1072    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  34.43 
 
 
2642 aa  1282    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  39.79 
 
 
2624 aa  1028    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  68.8 
 
 
2266 aa  3043    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  42.11 
 
 
2542 aa  727    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  100 
 
 
2298 aa  4625    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  39.83 
 
 
2764 aa  1061    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.61 
 
 
2661 aa  1053    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.52 
 
 
1772 aa  783    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  68.22 
 
 
2477 aa  1928    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.95 
 
 
2300 aa  806    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  41.32 
 
 
2693 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  63.5 
 
 
2249 aa  2863    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.19 
 
 
2704 aa  1055    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.81 
 
 
1845 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  44.43 
 
 
2448 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 
2619 aa  745    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  41.26 
 
 
2683 aa  708    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.58 
 
 
2338 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  41.71 
 
 
2553 aa  629  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  36.09 
 
 
2314 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  42 
 
 
2386 aa  600  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 
2816 aa  562  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  41.47 
 
 
2628 aa  559  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  35.63 
 
 
3008 aa  557  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  36 
 
 
2772 aa  506  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.38 
 
 
1631 aa  477  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  33.26 
 
 
2754 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
2614 aa  420  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  35.03 
 
 
2888 aa  412  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 
1656 aa  414  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 
1453 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.98 
 
 
2462 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 
1480 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  34.95 
 
 
1923 aa  399  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.79 
 
 
4478 aa  396  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 
1413 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  30.1 
 
 
1087 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  31.53 
 
 
1587 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  34.02 
 
 
1935 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.82 
 
 
3702 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.82 
 
 
3693 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  46.27 
 
 
3243 aa  387  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.82 
 
 
3693 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  46.07 
 
 
3115 aa  387  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  33.04 
 
 
1733 aa  386  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  33.86 
 
 
1929 aa  387  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.26 
 
 
1908 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  35.48 
 
 
1934 aa  384  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.68 
 
 
1984 aa  380  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.52 
 
 
3696 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.15 
 
 
3679 aa  377  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
2551 aa  373  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.77 
 
 
1985 aa  374  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.8 
 
 
3099 aa  373  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 
1354 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  32.7 
 
 
3427 aa  374  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.1 
 
 
3676 aa  373  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  30.98 
 
 
1144 aa  370  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.37 
 
 
2551 aa  371  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.54 
 
 
1372 aa  366  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.39 
 
 
1337 aa  366  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  32.61 
 
 
1740 aa  365  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 
2232 aa  364  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 
1955 aa  364  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.07 
 
 
1349 aa  362  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.95 
 
 
1349 aa  361  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.78 
 
 
1874 aa  358  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
4101 aa  358  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  30 
 
 
1101 aa  358  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2179  Beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 
1927 aa  357  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0632435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.31 
 
 
2880 aa  356  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  31.66 
 
 
7210 aa  355  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  29.37 
 
 
1559 aa  352  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  30.81 
 
 
1408 aa  351  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.69 
 
 
950 aa  349  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.16 
 
 
1559 aa  349  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.42 
 
 
1939 aa  348  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  32.04 
 
 
1470 aa  348  8e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.73 
 
 
2374 aa  347  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30.18 
 
 
1646 aa  347  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 
2477 aa  347  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>