More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5614 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  47.96 
 
 
1453 aa  1131    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  66.35 
 
 
1740 aa  1211    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1733 aa  3373    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.52 
 
 
1480 aa  1064    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
1413 aa  911    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.04 
 
 
1631 aa  483  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.95 
 
 
2300 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  33.93 
 
 
2298 aa  416  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.51 
 
 
1772 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.24 
 
 
2477 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.56 
 
 
2683 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.14 
 
 
2443 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.36 
 
 
2619 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.06 
 
 
2249 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  32.07 
 
 
2674 aa  393  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  32.22 
 
 
2640 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  32.26 
 
 
2657 aa  387  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.37 
 
 
2327 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 
2664 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  32.29 
 
 
2624 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  32.2 
 
 
2531 aa  380  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.77 
 
 
2694 aa  380  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 
2693 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  30.45 
 
 
2764 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  35.37 
 
 
2503 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 
2560 aa  364  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  29.22 
 
 
3008 aa  364  9e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  42.3 
 
 
1272 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
2628 aa  356  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.34 
 
 
2260 aa  356  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  42.39 
 
 
1764 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 
2266 aa  356  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.94 
 
 
2661 aa  356  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  32.09 
 
 
2542 aa  355  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.79 
 
 
2704 aa  346  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  29.55 
 
 
2642 aa  344  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 
2620 aa  333  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  45.82 
 
 
2386 aa  333  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.96 
 
 
2750 aa  332  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  41.22 
 
 
2189 aa  331  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.77 
 
 
2771 aa  330  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  38.85 
 
 
2703 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 
2772 aa  323  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  42.57 
 
 
2448 aa  321  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.84 
 
 
2414 aa  317  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  44.02 
 
 
2314 aa  314  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  42.74 
 
 
2553 aa  313  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.8 
 
 
2338 aa  310  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 
4478 aa  308  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 
3243 aa  307  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  42.04 
 
 
3115 aa  307  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.65 
 
 
1845 aa  305  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.24 
 
 
1656 aa  302  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  31.8 
 
 
2162 aa  301  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  26.69 
 
 
2754 aa  301  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.96 
 
 
3693 aa  296  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.96 
 
 
3693 aa  296  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.74 
 
 
3702 aa  293  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  31.29 
 
 
2880 aa  291  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  32.03 
 
 
1832 aa  290  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  25.79 
 
 
3099 aa  290  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  43.96 
 
 
2816 aa  289  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.01 
 
 
1087 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  27.79 
 
 
1354 aa  284  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.05 
 
 
3696 aa  281  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.5 
 
 
1101 aa  281  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  28.01 
 
 
2462 aa  281  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  31.3 
 
 
3101 aa  281  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27 
 
 
2551 aa  280  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29.8 
 
 
1587 aa  279  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.35 
 
 
1337 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  31.04 
 
 
7210 aa  279  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  30.65 
 
 
1470 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.46 
 
 
1372 aa  276  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.39 
 
 
3676 aa  276  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  32.46 
 
 
2614 aa  275  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  31.01 
 
 
3281 aa  274  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
7110 aa  274  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.44 
 
 
1349 aa  274  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
1837 aa  272  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
2551 aa  272  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.07 
 
 
1126 aa  270  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  26.85 
 
 
3252 aa  269  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  30.87 
 
 
1827 aa  269  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  32.35 
 
 
2108 aa  268  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  29.51 
 
 
1828 aa  268  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  29.72 
 
 
2604 aa  268  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.35 
 
 
1804 aa  267  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 
3679 aa  267  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  31.22 
 
 
7279 aa  267  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 
1939 aa  266  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 
1489 aa  267  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.9 
 
 
1984 aa  266  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
3092 aa  266  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  30.93 
 
 
1805 aa  264  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  36.16 
 
 
6876 aa  263  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  32.01 
 
 
4036 aa  263  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  31.61 
 
 
4080 aa  263  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.34 
 
 
2363 aa  263  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 
7157 aa  263  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>