More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1602 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  52.22 
 
 		 2771 aa  1566    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  100 
 
 		 2531 aa  5180    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  46.44 
 
 		 2448 aa  792    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.26 
 
 		 1845 aa  675    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  44.06 
 
 		 1764 aa  1181    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  45.33 
 
 		 1272 aa  1084    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  64.03 
 
 		 2750 aa  2073    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.95 
 
 		 2443 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.96 
 
 		 2477 aa  726    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  43.61 
 
 		 2560 aa  792    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  38.82 
 
 		 2260 aa  905    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  70.96 
 
 		 2704 aa  2333    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  65.89 
 
 		 2664 aa  2132    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.21 
 
 		 2414 aa  655    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.6 
 
 		 1772 aa  1194    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  87.4 
 
 		 2657 aa  2833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  87.88 
 
 		 2640 aa  2742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.99 
 
 		 2338 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  67.12 
 
 		 2620 aa  2128    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  71.22 
 
 		 2703 aa  2337    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  89.13 
 
 		 2624 aa  2784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 		 2266 aa  944    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  52.17 
 
 		 2542 aa  2364    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  43.42 
 
 		 2189 aa  701    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  51.41 
 
 		 2661 aa  1572    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  63.92 
 
 		 2764 aa  2066    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  71.76 
 
 		 2693 aa  2350    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  70.54 
 
 		 2694 aa  2333    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  38.7 
 
 		 2298 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.8 
 
 		 2300 aa  1187    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  68.66 
 
 		 2642 aa  3459    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  63.65 
 
 		 2619 aa  2041    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  63.6 
 
 		 2683 aa  2069    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  40.05 
 
 		 2553 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.54 
 
 		 2249 aa  600  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  38.83 
 
 		 2674 aa  593  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  38.85 
 
 		 2503 aa  576  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  37.78 
 
 		 2327 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  36.98 
 
 		 2314 aa  552  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  37.57 
 
 		 2386 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  37.24 
 
 		 3115 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 		 3243 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 		 2628 aa  520  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  33.61 
 
 		 3008 aa  514  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 		 2772 aa  504  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  35.8 
 
 		 2816 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.59 
 
 		 1631 aa  496  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 		 2754 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 2551 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.2 
 
 		 1656 aa  407  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  30.47 
 
 		 2462 aa  387  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 		 1453 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.32 
 
 		 1587 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  32 
 
 		 1413 aa  377  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 		 4478 aa  377  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  31.55 
 
 		 2888 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  32.02 
 
 		 4080 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  31.05 
 
 		 1740 aa  369  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  32.22 
 
 		 2614 aa  371  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 		 1923 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 		 1874 aa  365  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  30.01 
 
 		 1087 aa  365  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  31.4 
 
 		 1733 aa  365  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.54 
 
 		 1480 aa  364  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.27 
 
 		 1909 aa  362  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.98 
 
 		 2551 aa  362  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30 
 
 		 1646 aa  357  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.34 
 
 		 3099 aa  357  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.49 
 
 		 950 aa  356  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  30.14 
 
 		 1929 aa  353  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.4 
 
 		 1349 aa  352  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.17 
 
 		 1349 aa  350  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  29.72 
 
 		 1574 aa  351  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  29.19 
 
 		 1354 aa  351  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 		 3696 aa  348  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.97 
 
 		 1372 aa  348  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.65 
 
 		 1337 aa  347  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  29.83 
 
 		 1559 aa  344  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  30.57 
 
 		 1470 aa  344  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.53 
 
 		 3702 aa  344  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  31.09 
 
 		 1935 aa  343  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.01 
 
 		 1908 aa  342  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.6 
 
 		 1559 aa  341  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.89 
 
 		 1101 aa  337  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  30.56 
 
 		 3693 aa  337  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  30.56 
 
 		 3693 aa  337  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  28.57 
 
 		 3252 aa  336  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.83 
 
 		 2762 aa  336  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  31.28 
 
 		 1934 aa  336  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  30.98 
 
 		 2333 aa  337  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 		 1816 aa  336  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  29.88 
 
 		 4186 aa  336  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.41 
 
 		 1984 aa  333  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.18 
 
 		 3676 aa  333  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 5154 aa  333  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  28.6 
 
 		 7210 aa  334  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  31.43 
 
 		 3335 aa  332  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  28.33 
 
 		 2176 aa  332  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  30.4 
 
 		 2604 aa  332  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.62 
 
 		 3111 aa  331  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>