More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1115 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  47.79 
 
 		 2771 aa  1500    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  51.99 
 
 		 2531 aa  2355    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  39.11 
 
 		 2189 aa  874    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.53 
 
 		 2414 aa  646    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.62 
 
 		 1772 aa  1068    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  42.38 
 
 		 1764 aa  1078    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 1272 aa  988    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  58.22 
 
 		 2703 aa  1800    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 		 2560 aa  777    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  38.17 
 
 		 2260 aa  907    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  39.35 
 
 		 2298 aa  1001    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.44 
 
 		 1845 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  52.83 
 
 		 2664 aa  2526    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  55.39 
 
 		 2764 aa  1839    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  51.67 
 
 		 2704 aa  2484    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  46.39 
 
 		 2448 aa  786    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  52.6 
 
 		 2657 aa  2479    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  53.16 
 
 		 2640 aa  2447    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  52.09 
 
 		 2620 aa  2499    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41 
 
 		 2300 aa  1081    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  53.62 
 
 		 2624 aa  2471    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 		 2266 aa  957    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  51.95 
 
 		 2683 aa  2508    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  100 
 
 		 2542 aa  5166    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.9 
 
 		 2661 aa  1904    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  57.01 
 
 		 2694 aa  1783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  58.2 
 
 		 2693 aa  1802    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  55.04 
 
 		 2750 aa  1837    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.27 
 
 		 2477 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  50.68 
 
 		 2642 aa  2393    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.54 
 
 		 2249 aa  984    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  53.9 
 
 		 2619 aa  2556    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.52 
 
 		 2443 aa  714    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  40.18 
 
 		 2553 aa  608  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  38.68 
 
 		 2674 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  39.93 
 
 		 2503 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  37.54 
 
 		 2314 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  36.36 
 
 		 2327 aa  533  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  36.95 
 
 		 2386 aa  513  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  36.22 
 
 		 3243 aa  499  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  36.26 
 
 		 3115 aa  496  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  37.27 
 
 		 2628 aa  489  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.93 
 
 		 1631 aa  476  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  33.4 
 
 		 3008 aa  477  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 		 2816 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  32.79 
 
 		 2772 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 2754 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.3 
 
 		 1453 aa  384  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  33.16 
 
 		 2888 aa  380  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  31.47 
 
 		 1413 aa  374  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  31.48 
 
 		 1929 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  32.11 
 
 		 1935 aa  367  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.66 
 
 		 2462 aa  365  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 2551 aa  363  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.49 
 
 		 1656 aa  362  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.63 
 
 		 4478 aa  362  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  31.63 
 
 		 1985 aa  358  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 1874 aa  356  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  33.36 
 
 		 2338 aa  355  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 		 1923 aa  355  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 		 1480 aa  355  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.77 
 
 		 1908 aa  354  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  30.82 
 
 		 1934 aa  349  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.68 
 
 		 1349 aa  349  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  30.7 
 
 		 1959 aa  348  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.67 
 
 		 3099 aa  345  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  28.33 
 
 		 1349 aa  343  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  29.62 
 
 		 1087 aa  342  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 5154 aa  342  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  30.9 
 
 		 4080 aa  340  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 1816 aa  337  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  31.37 
 
 		 4840 aa  337  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  29.88 
 
 		 1144 aa  337  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29.13 
 
 		 1587 aa  337  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.95 
 
 		 1337 aa  336  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.06 
 
 		 3693 aa  336  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.06 
 
 		 3693 aa  336  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.49 
 
 		 1984 aa  336  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 		 2614 aa  335  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.11 
 
 		 2551 aa  335  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  29.29 
 
 		 3702 aa  335  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 		 7210 aa  334  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  29.6 
 
 		 1574 aa  334  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 		 1909 aa  333  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.37 
 
 		 1372 aa  332  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30.5 
 
 		 1646 aa  332  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.58 
 
 		 3427 aa  332  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  30.62 
 
 		 3696 aa  328  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.61 
 
 		 1939 aa  327  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  29.28 
 
 		 1354 aa  326  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  30.26 
 
 		 1955 aa  326  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  29.45 
 
 		 4111 aa  324  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  29.32 
 
 		 2316 aa  323  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.94 
 
 		 1101 aa  323  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  30.87 
 
 		 1548 aa  323  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  30.6 
 
 		 3176 aa  323  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 7110 aa  322  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 		 1740 aa  321  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  29.02 
 
 		 3676 aa  319  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  30.94 
 
 		 7279 aa  319  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>