More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1449 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1413 aa  2907    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  43.62 
 
 
1740 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 
1453 aa  946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.42 
 
 
1480 aa  919    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  36.5 
 
 
1733 aa  854    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  29.7 
 
 
1631 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.25 
 
 
2327 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  32.17 
 
 
1272 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  35.04 
 
 
2503 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.21 
 
 
2300 aa  403  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  32.52 
 
 
2386 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  32.92 
 
 
2298 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 
1764 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.57 
 
 
2477 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  30.45 
 
 
2620 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.81 
 
 
2249 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  31.88 
 
 
2531 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.34 
 
 
2189 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 
2664 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 
2657 aa  366  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 
2640 aa  366  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  31.6 
 
 
2542 aa  365  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  31.66 
 
 
2624 aa  365  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.75 
 
 
2260 aa  364  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.46 
 
 
2443 aa  364  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.75 
 
 
2771 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  31.02 
 
 
2553 aa  362  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.7 
 
 
2694 aa  361  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  30.59 
 
 
2693 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.97 
 
 
2414 aa  345  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  29.88 
 
 
2683 aa  343  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  31.57 
 
 
2266 aa  330  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  29.1 
 
 
2754 aa  328  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  30.77 
 
 
2448 aa  327  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  31.03 
 
 
2816 aa  323  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  30.16 
 
 
2772 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.56 
 
 
1772 aa  322  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  42.65 
 
 
2674 aa  319  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  37.62 
 
 
2703 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.62 
 
 
2704 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 
2619 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  37.43 
 
 
2642 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40 
 
 
2750 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38 
 
 
2661 aa  314  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  39.96 
 
 
2314 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  29.93 
 
 
1908 aa  313  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.23 
 
 
3099 aa  311  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  39.78 
 
 
2764 aa  310  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  41.25 
 
 
2338 aa  310  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.83 
 
 
1845 aa  304  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  41.15 
 
 
2560 aa  301  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27.91 
 
 
2551 aa  295  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  30.61 
 
 
2682 aa  295  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  26.89 
 
 
1087 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.65 
 
 
1984 aa  292  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  29.77 
 
 
4478 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
2551 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.86 
 
 
1337 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  30.34 
 
 
1923 aa  283  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 
1646 aa  282  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  30.27 
 
 
1929 aa  281  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  39.83 
 
 
2888 aa  281  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  29.16 
 
 
2316 aa  280  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  27.54 
 
 
3252 aa  280  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.97 
 
 
1939 aa  278  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  28.63 
 
 
3679 aa  278  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  28.67 
 
 
3702 aa  277  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  28.59 
 
 
2225 aa  276  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  29.85 
 
 
1951 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  28.64 
 
 
3693 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  28.64 
 
 
3693 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  27.69 
 
 
2462 aa  275  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  27.38 
 
 
1408 aa  274  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 
1656 aa  274  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  28.46 
 
 
1612 aa  273  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  28.46 
 
 
1612 aa  273  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.74 
 
 
2376 aa  273  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  30.08 
 
 
1934 aa  272  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  29.68 
 
 
2614 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  35.61 
 
 
3008 aa  272  4e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  28.53 
 
 
3101 aa  272  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  29.27 
 
 
1658 aa  271  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 
3243 aa  271  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  28.15 
 
 
2176 aa  271  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  35.62 
 
 
1937 aa  270  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 
3115 aa  271  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  29.82 
 
 
2880 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  40.45 
 
 
2628 aa  270  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  28.3 
 
 
3111 aa  270  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  30.9 
 
 
1535 aa  269  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.21 
 
 
1909 aa  269  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  34.35 
 
 
1696 aa  268  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.78 
 
 
1981 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.06 
 
 
1985 aa  268  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  29.01 
 
 
2604 aa  268  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  27.3 
 
 
4111 aa  267  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.13 
 
 
1951 aa  267  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 
2882 aa  266  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.86 
 
 
1987 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  28.47 
 
 
4575 aa  265  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>