More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1324 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  100 
 
 
1985 aa  4108    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  48.77 
 
 
2016 aa  1837    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  76.39 
 
 
1963 aa  3039    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  92.64 
 
 
1998 aa  3794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  70.18 
 
 
1979 aa  2824    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  92.08 
 
 
1981 aa  3742    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  68.85 
 
 
1951 aa  2761    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  76.01 
 
 
1981 aa  3036    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  76.12 
 
 
1976 aa  3005    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  69.18 
 
 
1985 aa  2788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  93.31 
 
 
1989 aa  3808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  75.56 
 
 
1989 aa  3021    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  56.65 
 
 
1899 aa  2144    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  50.44 
 
 
1971 aa  1917    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.64 
 
 
1928 aa  2681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  69.2 
 
 
1946 aa  2748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  93.41 
 
 
1987 aa  3820    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  69.49 
 
 
1937 aa  2758    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  38.1 
 
 
2368 aa  466  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.08 
 
 
2348 aa  437  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.11 
 
 
2336 aa  437  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  46.41 
 
 
453 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  31.69 
 
 
2396 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  31.16 
 
 
2276 aa  424  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 
2391 aa  417  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  44.23 
 
 
453 aa  399  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  29.36 
 
 
2275 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  47.76 
 
 
1605 aa  376  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.95 
 
 
2376 aa  376  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  33.51 
 
 
2882 aa  349  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.1 
 
 
3073 aa  313  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  39.9 
 
 
775 aa  286  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  31.48 
 
 
987 aa  275  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.79 
 
 
2300 aa  274  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.21 
 
 
1772 aa  268  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  36.06 
 
 
1413 aa  268  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 
1272 aa  266  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  27.44 
 
 
3527 aa  266  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 
1764 aa  266  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  34.27 
 
 
2386 aa  264  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  34.75 
 
 
2298 aa  259  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  33.99 
 
 
2531 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.32 
 
 
2443 aa  255  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.39 
 
 
2477 aa  253  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 
2624 aa  253  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  32.38 
 
 
2620 aa  253  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  34.6 
 
 
2448 aa  253  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 
2657 aa  252  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.48 
 
 
2704 aa  252  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  34.37 
 
 
2314 aa  252  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  32.67 
 
 
2642 aa  252  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  32.48 
 
 
2703 aa  252  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  32.48 
 
 
2693 aa  252  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  32.83 
 
 
2327 aa  251  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.48 
 
 
2694 aa  251  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 
2640 aa  251  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.45 
 
 
2661 aa  249  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.54 
 
 
2619 aa  243  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.42 
 
 
2664 aa  242  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 
3243 aa  241  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  32.26 
 
 
2338 aa  240  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  35.08 
 
 
3115 aa  240  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  32.99 
 
 
3008 aa  239  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.55 
 
 
2189 aa  238  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.25 
 
 
2683 aa  238  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.77 
 
 
2771 aa  237  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  30.92 
 
 
2764 aa  237  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.4 
 
 
2750 aa  237  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  30.67 
 
 
2542 aa  235  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.36 
 
 
2249 aa  234  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.19 
 
 
2560 aa  234  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 
2772 aa  233  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 
1109 aa  231  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.33 
 
 
2674 aa  229  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  36.02 
 
 
1107 aa  228  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.51 
 
 
2414 aa  227  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  30.97 
 
 
1951 aa  224  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.2 
 
 
1656 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.3 
 
 
2266 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.78 
 
 
1985 aa  223  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 
2816 aa  221  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
2628 aa  219  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  32.98 
 
 
1631 aa  219  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  31.04 
 
 
1453 aa  219  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  33.68 
 
 
2000 aa  219  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  33.82 
 
 
2036 aa  217  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  32.19 
 
 
1740 aa  216  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  31.42 
 
 
2888 aa  215  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  33.12 
 
 
1959 aa  215  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  32.5 
 
 
2754 aa  214  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  34.18 
 
 
2503 aa  213  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  32.7 
 
 
1934 aa  213  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  30.93 
 
 
3101 aa  211  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  30.34 
 
 
1841 aa  211  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  30.34 
 
 
1850 aa  211  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  30.34 
 
 
1850 aa  211  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.64 
 
 
2260 aa  211  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  31.1 
 
 
1840 aa  210  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  29.96 
 
 
1759 aa  210  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.79 
 
 
1908 aa  209  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>