More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3102 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  100 
 
 		 2016 aa  4198    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  48.72 
 
 		 1963 aa  1840    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  48.82 
 
 		 1985 aa  1874    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  48.21 
 
 		 1928 aa  1842    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  48.54 
 
 		 1998 aa  1872    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  49.3 
 
 		 1979 aa  1895    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  48.61 
 
 		 1946 aa  1857    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  48.44 
 
 		 1981 aa  1847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  48.32 
 
 		 1976 aa  1833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  48.18 
 
 		 1985 aa  1853    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  48.46 
 
 		 1981 aa  1865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  48.19 
 
 		 1987 aa  1868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  48.43 
 
 		 1989 aa  1843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  58.21 
 
 		 1899 aa  1064    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  48.68 
 
 		 1937 aa  1865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  48.84 
 
 		 1989 aa  1874    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  65.97 
 
 		 1971 aa  2764    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  48.88 
 
 		 1951 aa  1879    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  33.78 
 
 		 2368 aa  456  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  48.3 
 
 		 453 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.61 
 
 		 3073 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  32.81 
 
 		 2396 aa  433  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.58 
 
 		 2336 aa  433  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  45.96 
 
 		 453 aa  430  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.66 
 
 		 2348 aa  420  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.29 
 
 		 2376 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  30.55 
 
 		 2391 aa  417  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  29.24 
 
 		 2275 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  32.03 
 
 		 2276 aa  400  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  45.64 
 
 		 1605 aa  362  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  32.17 
 
 		 2882 aa  336  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  31.11 
 
 		 987 aa  292  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 		 1109 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.41 
 
 		 775 aa  268  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  36.81 
 
 		 1107 aa  266  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.51 
 
 		 2300 aa  259  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.26 
 
 		 3527 aa  255  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 		 1764 aa  252  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  35.01 
 
 		 1272 aa  250  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  35.49 
 
 		 2448 aa  250  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.15 
 
 		 1772 aa  248  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.99 
 
 		 2189 aa  239  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  32.52 
 
 		 1413 aa  238  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 		 2620 aa  235  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 		 2657 aa  234  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 		 2640 aa  234  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 		 2624 aa  234  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 		 2664 aa  233  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.4 
 
 		 2661 aa  232  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.63 
 
 		 2694 aa  231  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.63 
 
 		 2704 aa  231  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  32.63 
 
 		 2703 aa  231  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  32.84 
 
 		 2642 aa  231  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  32.63 
 
 		 2693 aa  231  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 		 2619 aa  230  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  32.91 
 
 		 2531 aa  229  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.73 
 
 		 2683 aa  226  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.06 
 
 		 2414 aa  225  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.44 
 
 		 2750 aa  225  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  32.27 
 
 		 2327 aa  223  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.98 
 
 		 2771 aa  222  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  32.63 
 
 		 2542 aa  221  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  31.73 
 
 		 2764 aa  220  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 		 1587 aa  219  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  32.99 
 
 		 2298 aa  217  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.07 
 
 		 1822 aa  216  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 1840 aa  214  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  32.14 
 
 		 1841 aa  214  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  32.14 
 
 		 1850 aa  214  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.77 
 
 		 1354 aa  214  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  32.14 
 
 		 1850 aa  214  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  32.07 
 
 		 1733 aa  213  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  31.74 
 
 		 2338 aa  213  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.43 
 
 		 2477 aa  212  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 		 1828 aa  212  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  31.38 
 
 		 1740 aa  212  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.37 
 
 		 2443 aa  211  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  33.88 
 
 		 1778 aa  211  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  31.89 
 
 		 2560 aa  210  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 		 2880 aa  209  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.1 
 
 		 3099 aa  208  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  30.95 
 
 		 3008 aa  207  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.53 
 
 		 2260 aa  207  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  31.8 
 
 		 2386 aa  207  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.13 
 
 		 2249 aa  207  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  31.67 
 
 		 2674 aa  206  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 2551 aa  205  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  31.76 
 
 		 3243 aa  205  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 		 1874 aa  205  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 		 1656 aa  201  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  31.44 
 
 		 3115 aa  201  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.8 
 
 		 1480 aa  201  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 5802 aa  200  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  30.75 
 
 		 2314 aa  200  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2376  Beta-ketoacyl synthase  29.4 
 
 		 1620 aa  199  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  26.55 
 
 		 1959 aa  199  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  31.85 
 
 		 2230 aa  198  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  30.13 
 
 		 1823 aa  197  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  26.32 
 
 		 2036 aa  197  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  31.78 
 
 		 1631 aa  196  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>