More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2268 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  59.41 
 
 
2391 aa  1612    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  42.25 
 
 
2275 aa  1641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  29.07 
 
 
2368 aa  809    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  63.79 
 
 
2348 aa  2977    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  61.45 
 
 
2396 aa  2895    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  45.25 
 
 
2376 aa  1939    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2276 aa  4665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  63.51 
 
 
2336 aa  2932    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  32.9 
 
 
2882 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.48 
 
 
3073 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.1 
 
 
1951 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  29.26 
 
 
1963 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  29.67 
 
 
1937 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.92 
 
 
1928 aa  446  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.51 
 
 
1946 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.26 
 
 
1979 aa  436  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.31 
 
 
1989 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.61 
 
 
1976 aa  430  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.96 
 
 
1981 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.16 
 
 
1985 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.5 
 
 
1985 aa  427  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  31.78 
 
 
1971 aa  423  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.72 
 
 
1989 aa  423  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.57 
 
 
1987 aa  420  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.48 
 
 
1998 aa  420  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  32.03 
 
 
2016 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  29.06 
 
 
1605 aa  390  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.93 
 
 
1981 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  30.64 
 
 
1107 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  30.08 
 
 
1109 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  34.3 
 
 
1899 aa  342  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  28.36 
 
 
1959 aa  337  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.12 
 
 
3527 aa  336  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.98 
 
 
2300 aa  316  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 
1272 aa  309  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 
2036 aa  309  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  38.06 
 
 
2189 aa  306  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  30.09 
 
 
2298 aa  299  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  28.42 
 
 
2553 aa  299  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  40.22 
 
 
2448 aa  298  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.36 
 
 
2477 aa  298  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  31.7 
 
 
2000 aa  296  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  36.11 
 
 
2642 aa  296  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.4 
 
 
2694 aa  296  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 
2693 aa  295  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  36.19 
 
 
2703 aa  295  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.9 
 
 
2704 aa  295  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  36.32 
 
 
2764 aa  289  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  36.5 
 
 
2664 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  34.96 
 
 
2620 aa  286  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.66 
 
 
2249 aa  286  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.42 
 
 
1772 aa  286  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 
2619 aa  285  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.96 
 
 
2750 aa  285  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  35.9 
 
 
2683 aa  284  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 
2640 aa  283  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 
1764 aa  283  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.29 
 
 
2443 aa  283  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 
2657 aa  283  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 
2624 aa  283  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  35.68 
 
 
2531 aa  283  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  27.05 
 
 
2674 aa  282  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  36.77 
 
 
2542 aa  277  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  28.5 
 
 
917 aa  276  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  38.44 
 
 
2560 aa  275  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 
453 aa  275  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.85 
 
 
2260 aa  273  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  36.22 
 
 
453 aa  269  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.77 
 
 
2661 aa  266  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.12 
 
 
3243 aa  263  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  38.12 
 
 
3115 aa  262  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
3702 aa  262  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
3693 aa  261  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
3693 aa  261  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 
2772 aa  259  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  29.26 
 
 
2266 aa  258  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.18 
 
 
1845 aa  258  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  38.84 
 
 
1631 aa  257  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  26.56 
 
 
3008 aa  257  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.69 
 
 
2771 aa  256  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  35.59 
 
 
2501 aa  256  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  36.71 
 
 
2338 aa  255  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.39 
 
 
2414 aa  255  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  28.23 
 
 
2314 aa  254  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.92 
 
 
1480 aa  254  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.31 
 
 
3676 aa  253  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  37.67 
 
 
2386 aa  253  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  29.59 
 
 
2628 aa  251  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  36.7 
 
 
1413 aa  249  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  28.76 
 
 
2503 aa  247  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  38.2 
 
 
1453 aa  247  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.32 
 
 
3696 aa  245  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.88 
 
 
3679 aa  244  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  32.78 
 
 
2754 aa  241  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3261  beta keto-acyl synthase  30.1 
 
 
2262 aa  239  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  30.22 
 
 
2258 aa  239  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  30.08 
 
 
2338 aa  238  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  30.08 
 
 
2294 aa  238  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1395  putative polyketide synthase  30.08 
 
 
2285 aa  238  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  30.08 
 
 
2287 aa  238  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>