More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2909 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  48.64 
 
 
2016 aa  1831    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  67.69 
 
 
1963 aa  2683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 
1946 aa  4037    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 
1605 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  84.94 
 
 
1951 aa  3397    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  69.52 
 
 
1981 aa  2757    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  69.35 
 
 
1985 aa  2770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.98 
 
 
1979 aa  2695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  69.53 
 
 
1998 aa  2790    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  69.43 
 
 
1987 aa  2783    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  66.87 
 
 
1981 aa  2669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.03 
 
 
1976 aa  2662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.3 
 
 
1985 aa  2667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  66.85 
 
 
1989 aa  2661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  57.03 
 
 
1899 aa  2157    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  49.48 
 
 
1971 aa  1880    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  69.57 
 
 
1989 aa  2782    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  71.58 
 
 
1928 aa  2843    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  84.54 
 
 
1937 aa  3407    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  36.66 
 
 
2368 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  30.15 
 
 
2396 aa  446  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.6 
 
 
3073 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  29.69 
 
 
2276 aa  437  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.26 
 
 
2336 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.18 
 
 
2376 aa  426  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  31.6 
 
 
2391 aa  424  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  46.06 
 
 
453 aa  420  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.32 
 
 
2348 aa  420  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  30.48 
 
 
2275 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
453 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  33.82 
 
 
2882 aa  345  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.94 
 
 
775 aa  285  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  35.98 
 
 
2386 aa  262  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.88 
 
 
2300 aa  261  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 
1413 aa  259  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.21 
 
 
1772 aa  257  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  37.82 
 
 
987 aa  254  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  34.11 
 
 
1272 aa  253  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  33.33 
 
 
2327 aa  251  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  33.06 
 
 
1764 aa  248  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  34.73 
 
 
2448 aa  246  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  36.75 
 
 
1107 aa  246  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  32.52 
 
 
2620 aa  245  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  34.18 
 
 
2314 aa  245  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.27 
 
 
2661 aa  243  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  31.66 
 
 
3008 aa  243  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  35.07 
 
 
2674 aa  241  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 
2664 aa  241  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
2624 aa  241  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
2657 aa  240  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
2640 aa  240  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.12 
 
 
2619 aa  240  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.14 
 
 
2189 aa  240  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  32.91 
 
 
2531 aa  239  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  31.86 
 
 
2642 aa  239  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.66 
 
 
2704 aa  239  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  31.66 
 
 
2693 aa  239  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  31.66 
 
 
2703 aa  239  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.66 
 
 
2694 aa  238  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  28.38 
 
 
3527 aa  238  9e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 
1109 aa  234  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32 
 
 
2477 aa  233  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.86 
 
 
2443 aa  232  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  32.17 
 
 
2542 aa  231  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  33.47 
 
 
2338 aa  231  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  32.45 
 
 
2298 aa  231  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.87 
 
 
2750 aa  228  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.89 
 
 
2771 aa  227  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  32.14 
 
 
2764 aa  227  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.71 
 
 
2683 aa  227  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 
3115 aa  226  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 
3243 aa  226  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 
2772 aa  225  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.14 
 
 
2414 aa  225  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  33.53 
 
 
2560 aa  222  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  34.4 
 
 
2503 aa  221  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  31.44 
 
 
1631 aa  217  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  35.14 
 
 
2628 aa  216  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.22 
 
 
2249 aa  215  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.38 
 
 
1480 aa  214  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 
2816 aa  213  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  34.36 
 
 
1985 aa  213  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.58 
 
 
3099 aa  212  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.68 
 
 
1453 aa  210  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 
2036 aa  209  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 
2000 aa  209  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  30.83 
 
 
2553 aa  206  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  32.77 
 
 
1959 aa  204  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  31.93 
 
 
1841 aa  202  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  31.93 
 
 
1850 aa  202  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  31.93 
 
 
1850 aa  202  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.44 
 
 
2260 aa  202  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 
2266 aa  202  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  32.42 
 
 
1934 aa  201  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 
1840 aa  199  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.56 
 
 
1587 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  30.6 
 
 
1759 aa  195  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  30.61 
 
 
2888 aa  194  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  30.72 
 
 
1823 aa  194  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 
1656 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>