More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1599 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  48.72 
 
 		 2016 aa  1820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  100 
 
 		 1963 aa  4058    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  68.23 
 
 		 1951 aa  2706    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  68.74 
 
 		 1937 aa  2716    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  75.67 
 
 		 1989 aa  3038    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  42.04 
 
 		 1605 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.64 
 
 		 1946 aa  2684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  66.65 
 
 		 1928 aa  2647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  68.21 
 
 		 1979 aa  2734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  92.66 
 
 		 1981 aa  3732    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  93.15 
 
 		 1976 aa  3690    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  68.22 
 
 		 1985 aa  2732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  92.96 
 
 		 1989 aa  3750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  76.39 
 
 		 1985 aa  3057    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  58.21 
 
 		 1899 aa  2144    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  50 
 
 		 1971 aa  1898    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  75.78 
 
 		 1998 aa  3043    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  76.88 
 
 		 1981 aa  3040    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  76.07 
 
 		 1987 aa  3046    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  36.2 
 
 		 2368 aa  572  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.24 
 
 		 2348 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  29.25 
 
 		 2276 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.15 
 
 		 2336 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  31.07 
 
 		 2396 aa  430  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  46.93 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 		 2391 aa  416  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.27 
 
 		 3073 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  45.39 
 
 		 453 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.88 
 
 		 2376 aa  407  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  29.49 
 
 		 2275 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  35.39 
 
 		 2882 aa  354  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.03 
 
 		 775 aa  290  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.1 
 
 		 2300 aa  277  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  29.7 
 
 		 3527 aa  271  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.82 
 
 		 1772 aa  271  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  35.27 
 
 		 1272 aa  271  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  30.46 
 
 		 987 aa  270  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 2620 aa  263  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 		 1413 aa  263  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  34.96 
 
 		 2386 aa  262  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.27 
 
 		 2704 aa  258  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  34.02 
 
 		 2448 aa  258  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  33.46 
 
 		 2642 aa  258  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  33.27 
 
 		 2703 aa  258  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 		 2693 aa  258  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.27 
 
 		 2694 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  33.76 
 
 		 1764 aa  256  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  33.27 
 
 		 2531 aa  255  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  33.68 
 
 		 2314 aa  253  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  31.64 
 
 		 2624 aa  253  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  31.95 
 
 		 2657 aa  252  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  33.12 
 
 		 2298 aa  251  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  32.58 
 
 		 2640 aa  251  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 		 2664 aa  250  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  34.23 
 
 		 2338 aa  250  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  32.7 
 
 		 2327 aa  249  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.69 
 
 		 2189 aa  249  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.05 
 
 		 2661 aa  247  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.36 
 
 		 2750 aa  246  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.02 
 
 		 2619 aa  246  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.63 
 
 		 2443 aa  244  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.84 
 
 		 2477 aa  244  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  32.07 
 
 		 2764 aa  243  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.65 
 
 		 2683 aa  243  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  37.34 
 
 		 1109 aa  238  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.72 
 
 		 2249 aa  237  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  32.33 
 
 		 2542 aa  237  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.12 
 
 		 2674 aa  236  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.05 
 
 		 2771 aa  236  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  33 
 
 		 2560 aa  235  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 		 3115 aa  231  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.67 
 
 		 2414 aa  231  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 		 3243 aa  230  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  36.9 
 
 		 1107 aa  229  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  33.05 
 
 		 1480 aa  226  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  32.35 
 
 		 3008 aa  225  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 2772 aa  223  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.63 
 
 		 1453 aa  221  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  32.89 
 
 		 2266 aa  221  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  31.6 
 
 		 1631 aa  219  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 		 2000 aa  218  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 2036 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  33.88 
 
 		 1959 aa  216  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 2551 aa  215  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  31.6 
 
 		 1740 aa  214  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.05 
 
 		 2260 aa  214  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.54 
 
 		 3099 aa  214  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.69 
 
 		 2754 aa  214  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  32.19 
 
 		 1934 aa  213  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  33.83 
 
 		 2503 aa  213  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 1704 aa  213  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  30.65 
 
 		 2553 aa  212  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  31.96 
 
 		 1696 aa  212  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 		 2628 aa  212  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  29.58 
 
 		 2501 aa  211  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  32.46 
 
 		 2816 aa  210  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  33.69 
 
 		 1985 aa  209  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  33.47 
 
 		 2888 aa  209  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  31.4 
 
 		 1841 aa  208  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  30.08 
 
 		 1951 aa  207  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>