More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2104 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  61.66 
 
 		 2276 aa  2904    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  68.59 
 
 		 2348 aa  3266    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  29.94 
 
 		 2368 aa  827    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  43.59 
 
 		 2376 aa  1901    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  54.77 
 
 		 2275 aa  882    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  94.2 
 
 		 2391 aa  4374    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2396 aa  4873    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  63.45 
 
 		 2336 aa  2937    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.22 
 
 		 3073 aa  550  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  30.62 
 
 		 1937 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.99 
 
 		 1951 aa  466  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.57 
 
 		 1946 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.4 
 
 		 1928 aa  459  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.84 
 
 		 1979 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.43 
 
 		 1985 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.27 
 
 		 1976 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  29.91 
 
 		 1963 aa  446  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.98 
 
 		 1981 aa  446  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.59 
 
 		 1987 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.1 
 
 		 1998 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.09 
 
 		 1989 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.95 
 
 		 1989 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.36 
 
 		 1985 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.16 
 
 		 1981 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 		 2882 aa  435  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  30.66 
 
 		 2016 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  33.67 
 
 		 1971 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  28.51 
 
 		 1605 aa  403  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  27.88 
 
 		 1109 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  27.51 
 
 		 1107 aa  380  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  33.28 
 
 		 1899 aa  331  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.68 
 
 		 3527 aa  309  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 		 1272 aa  303  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.15 
 
 		 2300 aa  296  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  28.12 
 
 		 917 aa  293  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  28.97 
 
 		 2298 aa  290  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  30.55 
 
 		 2036 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  33.12 
 
 		 1959 aa  288  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.38 
 
 		 2477 aa  286  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.81 
 
 		 2443 aa  283  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.21 
 
 		 1772 aa  281  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 		 453 aa  280  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  37.08 
 
 		 2189 aa  279  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 		 453 aa  278  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  33.46 
 
 		 2000 aa  275  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.22 
 
 		 2249 aa  274  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  36.91 
 
 		 1764 aa  273  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  27.06 
 
 		 2674 aa  273  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  37.04 
 
 		 2542 aa  273  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  28.11 
 
 		 2553 aa  273  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  38.01 
 
 		 2448 aa  270  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  34.77 
 
 		 2620 aa  269  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  34.73 
 
 		 2764 aa  268  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.83 
 
 		 2704 aa  268  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.04 
 
 		 2694 aa  268  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  35.04 
 
 		 2642 aa  268  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  34.83 
 
 		 2693 aa  267  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  34.83 
 
 		 2703 aa  267  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 		 2619 aa  266  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  35.97 
 
 		 2260 aa  266  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.95 
 
 		 2661 aa  266  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  35.27 
 
 		 2664 aa  264  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.62 
 
 		 2750 aa  262  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  34.99 
 
 		 2531 aa  262  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 		 2657 aa  262  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 		 2640 aa  262  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 		 2624 aa  262  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  34.19 
 
 		 2683 aa  261  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.97 
 
 		 2414 aa  259  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  38.78 
 
 		 2338 aa  258  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  35.65 
 
 		 1696 aa  258  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  35.71 
 
 		 2501 aa  258  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.33 
 
 		 2771 aa  257  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 		 2560 aa  256  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  30.85 
 
 		 2628 aa  256  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  29.3 
 
 		 2503 aa  254  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  29.22 
 
 		 2314 aa  252  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  37.42 
 
 		 1413 aa  251  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.83 
 
 		 1631 aa  250  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 		 3115 aa  250  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 		 3243 aa  250  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  37.86 
 
 		 2266 aa  247  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 3693 aa  246  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 3693 aa  246  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 3702 aa  246  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 		 1480 aa  246  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 		 3676 aa  245  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 		 2754 aa  243  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  35.36 
 
 		 5915 aa  242  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  35.36 
 
 		 5993 aa  242  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  37.33 
 
 		 2386 aa  242  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  35.36 
 
 		 4212 aa  241  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  35.36 
 
 		 5822 aa  241  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  35.36 
 
 		 5778 aa  241  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.88 
 
 		 1845 aa  240  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  35 
 
 		 2772 aa  239  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  34.78 
 
 		 3525 aa  239  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  37.05 
 
 		 1749 aa  238  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 		 1453 aa  238  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  37.05 
 
 		 1619 aa  238  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>