More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1672 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  100 
 
 
3527 aa  7227    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  24.79 
 
 
2266 aa  333  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  30.12 
 
 
2276 aa  328  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  30.69 
 
 
2396 aa  303  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.16 
 
 
2376 aa  299  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.32 
 
 
2336 aa  298  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  30.13 
 
 
2036 aa  297  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.18 
 
 
2348 aa  290  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  30.22 
 
 
2391 aa  289  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  32.75 
 
 
1959 aa  288  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  37.72 
 
 
3008 aa  287  3.0000000000000004e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
3099 aa  284  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.4 
 
 
1989 aa  283  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 
2000 aa  281  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.16 
 
 
1987 aa  280  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.24 
 
 
1951 aa  277  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.11 
 
 
1998 aa  277  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.76 
 
 
1981 aa  277  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  30.24 
 
 
1963 aa  274  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.55 
 
 
1985 aa  271  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.17 
 
 
1981 aa  269  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.32 
 
 
1772 aa  268  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.88 
 
 
4478 aa  268  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.79 
 
 
1939 aa  267  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.57 
 
 
1979 aa  263  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.88 
 
 
3676 aa  263  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.34 
 
 
1989 aa  263  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.53 
 
 
2772 aa  263  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
3693 aa  262  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
3693 aa  262  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 
1656 aa  262  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 
1272 aa  262  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
3702 aa  262  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.33 
 
 
1976 aa  261  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  34.13 
 
 
1208 aa  258  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  29.97 
 
 
1937 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.93 
 
 
3111 aa  256  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.89 
 
 
950 aa  256  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.85 
 
 
2443 aa  255  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.4 
 
 
1985 aa  255  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.85 
 
 
2477 aa  254  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  35.11 
 
 
1764 aa  254  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
2551 aa  254  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.98 
 
 
2300 aa  253  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  34.61 
 
 
3101 aa  253  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.33 
 
 
2704 aa  251  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.89 
 
 
1805 aa  252  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  34.33 
 
 
2683 aa  251  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 
2693 aa  252  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  34.33 
 
 
2703 aa  252  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.95 
 
 
2136 aa  251  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.33 
 
 
2694 aa  251  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  34.33 
 
 
2642 aa  251  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  33.76 
 
 
2619 aa  251  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  36.13 
 
 
2298 aa  250  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  35.12 
 
 
1413 aa  250  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  35.26 
 
 
2545 aa  248  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  34.19 
 
 
2764 aa  248  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.98 
 
 
1822 aa  247  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.33 
 
 
2750 aa  247  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 
2545 aa  247  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  34.67 
 
 
2542 aa  247  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.63 
 
 
3080 aa  247  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.38 
 
 
1946 aa  247  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 
1354 aa  246  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 
3679 aa  247  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.53 
 
 
1804 aa  246  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
2544 aa  246  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
2544 aa  246  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 
2620 aa  246  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  35.24 
 
 
2546 aa  245  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  35.05 
 
 
2880 aa  244  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  35.27 
 
 
2546 aa  244  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  35.27 
 
 
2546 aa  244  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  35.27 
 
 
2546 aa  244  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 
2664 aa  244  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  35.27 
 
 
2546 aa  244  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  35.27 
 
 
2546 aa  244  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  35.27 
 
 
2546 aa  243  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  35.94 
 
 
2162 aa  243  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.16 
 
 
1631 aa  243  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
1874 aa  243  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  36.44 
 
 
2314 aa  242  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  30.34 
 
 
2016 aa  242  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.69 
 
 
4183 aa  241  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  34.89 
 
 
2975 aa  242  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.91 
 
 
3696 aa  242  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 
1812 aa  242  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 
1828 aa  241  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  32.85 
 
 
1646 aa  240  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.25 
 
 
1087 aa  240  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.46 
 
 
2249 aa  240  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  34.12 
 
 
2531 aa  239  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  32.63 
 
 
3252 aa  238  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  35.21 
 
 
2543 aa  238  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  33.81 
 
 
2439 aa  238  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  31.5 
 
 
2501 aa  238  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 
1580 aa  237  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  35.04 
 
 
2674 aa  237  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  34.57 
 
 
3243 aa  237  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>