More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1417 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  48.16 
 
 
2016 aa  1839    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  75.67 
 
 
1963 aa  3028    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  69.14 
 
 
1937 aa  2773    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  97.3 
 
 
1989 aa  4009    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  92.64 
 
 
1985 aa  3794    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  93.69 
 
 
1981 aa  3826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  69.98 
 
 
1979 aa  2815    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 
1998 aa  4131    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.15 
 
 
1928 aa  2663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  75.28 
 
 
1981 aa  3027    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  75.62 
 
 
1976 aa  3006    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  69.11 
 
 
1985 aa  2784    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  75.16 
 
 
1989 aa  3016    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  56.82 
 
 
1899 aa  2140    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  68.77 
 
 
1951 aa  2767    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  50.12 
 
 
1971 aa  1916    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  69.32 
 
 
1946 aa  2769    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  96.8 
 
 
1987 aa  3984    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  36.01 
 
 
2368 aa  545  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.16 
 
 
2348 aa  432  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.45 
 
 
2336 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  47.17 
 
 
453 aa  430  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.89 
 
 
3073 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  30.88 
 
 
2396 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  30.48 
 
 
2276 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 
2391 aa  416  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.08 
 
 
2376 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  44.35 
 
 
453 aa  400  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  29.47 
 
 
2275 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  47.23 
 
 
1605 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  34.72 
 
 
2882 aa  351  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.61 
 
 
775 aa  304  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  31.54 
 
 
987 aa  275  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.63 
 
 
1772 aa  275  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  34.89 
 
 
1272 aa  271  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  28.01 
 
 
3527 aa  271  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.27 
 
 
2300 aa  271  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  35.24 
 
 
1764 aa  266  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 
1413 aa  263  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  34.75 
 
 
2386 aa  261  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  33.87 
 
 
2314 aa  261  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  34.61 
 
 
2298 aa  256  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.48 
 
 
2661 aa  255  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.52 
 
 
2443 aa  256  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  34.3 
 
 
2448 aa  254  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.59 
 
 
2477 aa  253  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  33.76 
 
 
2620 aa  251  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  32.77 
 
 
2327 aa  250  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  32.93 
 
 
2531 aa  247  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  33.74 
 
 
3008 aa  246  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  36.1 
 
 
3243 aa  246  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  36 
 
 
3115 aa  246  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 
2657 aa  244  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 
2640 aa  244  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 
2624 aa  244  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.48 
 
 
2664 aa  243  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  31.84 
 
 
2703 aa  243  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.84 
 
 
2704 aa  243  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  32.24 
 
 
2642 aa  243  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  31.84 
 
 
2693 aa  243  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.84 
 
 
2694 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.84 
 
 
2189 aa  242  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  33.07 
 
 
2338 aa  239  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  32.69 
 
 
2542 aa  239  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.55 
 
 
2619 aa  238  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  37.66 
 
 
1107 aa  237  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.33 
 
 
2750 aa  236  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.91 
 
 
2771 aa  236  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  33.4 
 
 
2764 aa  235  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  34.53 
 
 
1109 aa  234  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.7 
 
 
2683 aa  234  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 
2560 aa  233  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34 
 
 
2772 aa  233  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  32.57 
 
 
2674 aa  233  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.85 
 
 
2249 aa  229  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.4 
 
 
2414 aa  228  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 
2266 aa  224  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 
2628 aa  223  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  34.04 
 
 
2000 aa  223  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  31.51 
 
 
2816 aa  221  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 
2036 aa  220  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  31.38 
 
 
1951 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  31.76 
 
 
1934 aa  219  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  34.17 
 
 
1959 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.92 
 
 
1985 aa  218  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  33.47 
 
 
1631 aa  218  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.02 
 
 
1453 aa  218  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.19 
 
 
1656 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 
1740 aa  217  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  33.91 
 
 
2503 aa  216  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  28.29 
 
 
4036 aa  213  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  32.22 
 
 
2888 aa  213  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.19 
 
 
2260 aa  213  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  32.3 
 
 
2754 aa  213  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 
1704 aa  211  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  33.96 
 
 
1480 aa  211  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 
1759 aa  209  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
2551 aa  209  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  30.98 
 
 
2553 aa  208  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  31.91 
 
 
1850 aa  208  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>