More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3101 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  61.58 
 
 
2477 aa  1397    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.49 
 
 
2771 aa  973    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  38.81 
 
 
2531 aa  922    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.2 
 
 
2694 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  61.98 
 
 
2443 aa  1382    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  46.65 
 
 
2189 aa  1158    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.08 
 
 
2704 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  40.17 
 
 
1764 aa  740    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  37.41 
 
 
2764 aa  945    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 
1272 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  41.93 
 
 
2703 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  40.63 
 
 
2683 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  41.86 
 
 
2560 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  41.24 
 
 
2260 aa  956    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  54.85 
 
 
2414 aa  989    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  39.73 
 
 
2664 aa  1044    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  46.32 
 
 
1845 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  68.65 
 
 
2298 aa  3087    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 
2657 aa  699    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  42.07 
 
 
2640 aa  700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 
2620 aa  953    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 
2624 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2266 aa  4565    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  41.26 
 
 
2542 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.8 
 
 
1772 aa  750    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.86 
 
 
2661 aa  719    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  63.02 
 
 
2249 aa  2754    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  38.88 
 
 
2448 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  34.55 
 
 
2674 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  41.84 
 
 
2642 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  41.54 
 
 
2693 aa  699    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  38.86 
 
 
2386 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.93 
 
 
2300 aa  797    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.12 
 
 
2750 aa  930    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 
2619 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  41.45 
 
 
2338 aa  636  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  34.76 
 
 
2327 aa  633  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  37.06 
 
 
2503 aa  621  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  41.66 
 
 
2553 aa  612  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  37.15 
 
 
2314 aa  602  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 
2628 aa  545  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 
2816 aa  536  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  34.41 
 
 
3008 aa  531  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
3115 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 
2772 aa  489  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.25 
 
 
2754 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  34.84 
 
 
1631 aa  436  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 
2614 aa  400  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  35.18 
 
 
2888 aa  397  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  34.49 
 
 
1453 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  32.92 
 
 
1935 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 
2462 aa  374  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.37 
 
 
1656 aa  367  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  30.47 
 
 
1087 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  33 
 
 
1480 aa  362  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  45.74 
 
 
3243 aa  361  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  34.03 
 
 
1929 aa  358  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.63 
 
 
1587 aa  355  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
2551 aa  355  8e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  34.73 
 
 
1934 aa  352  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  31.57 
 
 
1413 aa  350  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 
1733 aa  350  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
1923 aa  349  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  32.77 
 
 
1740 aa  349  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.98 
 
 
4478 aa  346  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.53 
 
 
1337 aa  346  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
1874 aa  345  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 
2551 aa  344  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 
3693 aa  342  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 
3693 aa  342  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  29.6 
 
 
1144 aa  342  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 
3702 aa  341  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.44 
 
 
3099 aa  341  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.29 
 
 
1985 aa  341  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 
1470 aa  340  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 
1908 aa  339  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.85 
 
 
1984 aa  338  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  32.7 
 
 
1489 aa  336  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.53 
 
 
1101 aa  333  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  29.55 
 
 
1354 aa  333  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.11 
 
 
950 aa  331  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.35 
 
 
1372 aa  330  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  31.76 
 
 
1349 aa  329  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.53 
 
 
1349 aa  328  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  30.87 
 
 
1574 aa  326  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 
1955 aa  323  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.63 
 
 
7210 aa  323  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.41 
 
 
3427 aa  323  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.47 
 
 
3696 aa  322  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  31.4 
 
 
2225 aa  322  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  32.32 
 
 
2943 aa  321  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 
2880 aa  320  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  24.02 
 
 
3527 aa  319  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  31.88 
 
 
1472 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.62 
 
 
1909 aa  318  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  31.88 
 
 
1472 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.9 
 
 
3676 aa  318  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  33.18 
 
 
1548 aa  317  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  31.88 
 
 
1472 aa  317  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.58 
 
 
2374 aa  315  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>