More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4083 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  55.31 
 
 		 1985 aa  1928    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  44.94 
 
 		 1908 aa  1555    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  54.8 
 
 		 1929 aa  1862    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  40.86 
 
 		 1951 aa  1033    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2179  Beta-ketoacyl synthase  53.06 
 
 		 1927 aa  1619    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0632435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  54.96 
 
 		 1935 aa  1822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.99 
 
 		 1984 aa  1414    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  56.44 
 
 		 1923 aa  1906    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  100 
 
 		 1934 aa  3736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  44.24 
 
 		 2888 aa  633  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8249  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  46.6 
 
 		 1501 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  35.64 
 
 		 2553 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  35.59 
 
 		 2298 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  30.36 
 
 		 3008 aa  391  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.5 
 
 		 2300 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  37.42 
 
 		 2314 aa  390  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  35.41 
 
 		 2189 aa  390  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.31 
 
 		 2477 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  31.68 
 
 		 1272 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.67 
 
 		 2772 aa  373  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  31.93 
 
 		 3243 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.36 
 
 		 2249 aa  373  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.64 
 
 		 2414 aa  367  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.97 
 
 		 1772 aa  365  7.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  31.12 
 
 		 1764 aa  364  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.16 
 
 		 2443 aa  364  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  32.46 
 
 		 3115 aa  363  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 		 2560 aa  361  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.34 
 
 		 1845 aa  360  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  34.59 
 
 		 2503 aa  360  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.15 
 
 		 2619 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.5 
 
 		 2750 aa  357  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.02 
 
 		 2327 aa  357  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.81 
 
 		 2683 aa  351  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  35.24 
 
 		 2386 aa  348  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  31.97 
 
 		 2664 aa  348  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 		 2640 aa  348  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  30.82 
 
 		 2542 aa  344  8e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  35.15 
 
 		 2266 aa  343  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  31.7 
 
 		 2657 aa  342  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  31.1 
 
 		 2531 aa  341  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.93 
 
 		 2260 aa  339  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.05 
 
 		 2674 aa  339  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.62 
 
 		 2661 aa  339  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  31.25 
 
 		 2764 aa  338  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  31.19 
 
 		 2624 aa  338  9e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  31.31 
 
 		 2620 aa  337  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  34.59 
 
 		 2628 aa  331  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.82 
 
 		 2771 aa  330  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  32.89 
 
 		 1631 aa  330  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.3 
 
 		 1372 aa  326  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  29.19 
 
 		 2754 aa  323  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.95 
 
 		 2462 aa  321  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 		 1354 aa  320  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.81 
 
 		 2694 aa  320  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.93 
 
 		 4478 aa  320  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.68 
 
 		 2704 aa  320  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  29.59 
 
 		 2693 aa  319  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  29.15 
 
 		 2703 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.31 
 
 		 1087 aa  317  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  29.28 
 
 		 2642 aa  315  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.58 
 
 		 3099 aa  311  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29.04 
 
 		 1587 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  34.21 
 
 		 2816 aa  308  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.91 
 
 		 1656 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 1828 aa  307  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.21 
 
 		 3679 aa  306  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.84 
 
 		 3702 aa  304  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  33.6 
 
 		 1304 aa  304  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  32.95 
 
 		 2477 aa  304  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 1874 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.61 
 
 		 3693 aa  302  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.61 
 
 		 3693 aa  302  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  30.65 
 
 		 3696 aa  297  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  28.91 
 
 		 1909 aa  296  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  31.57 
 
 		 1470 aa  296  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1577 aa  295  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.94 
 
 		 3676 aa  294  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 5154 aa  291  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  32.69 
 
 		 1805 aa  291  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  33.22 
 
 		 1581 aa  291  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  34.06 
 
 		 3427 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  32.22 
 
 		 1489 aa  290  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.43 
 
 		 1337 aa  289  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 		 2682 aa  288  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.23 
 
 		 1939 aa  288  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  28.36 
 
 		 1559 aa  288  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  29.01 
 
 		 1144 aa  288  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  33.6 
 
 		 1580 aa  287  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  33.6 
 
 		 1580 aa  287  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  32.36 
 
 		 1823 aa  287  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.99 
 
 		 1559 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  31.28 
 
 		 2604 aa  285  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6235  beta-ketoacyl synthase  32.17 
 
 		 1303 aa  284  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  32.8 
 
 		 2066 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  26.16 
 
 		 2551 aa  283  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  28.28 
 
 		 1424 aa  283  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 2551 aa  283  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  38.9 
 
 		 2448 aa  283  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  31.37 
 
 		 2498 aa  283  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>