More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6235 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  54.64 
 
 		 1304 aa  1313    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6235  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1303 aa  2611    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 		 2551 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  31.85 
 
 		 1354 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.46 
 
 		 1087 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 1874 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.38 
 
 		 1587 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.43 
 
 		 2880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  36.57 
 
 		 1559 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.43 
 
 		 3702 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 		 3176 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 		 3679 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 		 3693 aa  566  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 		 3693 aa  566  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 		 2477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.46 
 
 		 1559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.83 
 
 		 1337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.05 
 
 		 4478 aa  562  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.25 
 
 		 1349 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  41.33 
 
 		 3645 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 		 1656 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.91 
 
 		 1349 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 3676 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 		 3696 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 		 2551 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 		 1939 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.65 
 
 		 1101 aa  529  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.66 
 
 		 2232 aa  524  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 		 2762 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 		 2462 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 		 1144 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.93 
 
 		 1372 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 2230 aa  506  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  37.99 
 
 		 3099 aa  503  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.16 
 
 		 1804 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  33.98 
 
 		 3252 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  36.69 
 
 		 3130 aa  499  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36 
 
 		 2333 aa  496  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 		 1909 aa  496  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.61 
 
 		 3427 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.18 
 
 		 2136 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  38.88 
 
 		 3424 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 		 2985 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  36.35 
 
 		 2376 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  37.02 
 
 		 1966 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.62 
 
 		 1822 aa  482  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.67 
 
 		 3111 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.05 
 
 		 2890 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  37.64 
 
 		 2108 aa  482  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  38.43 
 
 		 1822 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 		 3033 aa  479  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  38.07 
 
 		 4151 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.84 
 
 		 3494 aa  479  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.6 
 
 		 1909 aa  479  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 5400 aa  479  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  37.08 
 
 		 3449 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  38.49 
 
 		 3711 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  31.77 
 
 		 3718 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  38.93 
 
 		 3045 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  31.01 
 
 		 1302 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5925  beta-ketoacyl synthase  36.77 
 
 		 2644 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 3092 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  38.74 
 
 		 3463 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  34.11 
 
 		 2134 aa  476  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.92 
 
 		 2225 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  37.3 
 
 		 1658 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  38.71 
 
 		 1602 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 7110 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  34.42 
 
 		 1402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  38.53 
 
 		 1812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 7210 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.71 
 
 		 1867 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  37.01 
 
 		 2066 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 		 3254 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.85 
 
 		 2966 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 		 3493 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.11 
 
 		 7279 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  37.1 
 
 		 3337 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.15 
 
 		 950 aa  469  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  38.25 
 
 		 4268 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.43 
 
 		 6889 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 1816 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.26 
 
 		 3930 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 2374 aa  466  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  38.1 
 
 		 2943 aa  466  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.54 
 
 		 4080 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  39.68 
 
 		 3355 aa  465  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  38.3 
 
 		 3158 aa  466  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  37.57 
 
 		 2604 aa  466  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 		 2047 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  38.45 
 
 		 3508 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 5154 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  37.65 
 
 		 6768 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.11 
 
 		 3670 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.27 
 
 		 2719 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  38.5 
 
 		 3148 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  33.44 
 
 		 1208 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  37.56 
 
 		 1548 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 1805 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  38.94 
 
 		 2107 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>