More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2011 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  100 
 
 
2348 aa  4767    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  45.8 
 
 
2376 aa  1967    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  68.64 
 
 
2391 aa  3198    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  68.67 
 
 
2336 aa  3202    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 
2275 aa  1669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  63.79 
 
 
2276 aa  2985    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  68.32 
 
 
2396 aa  3264    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  34.6 
 
 
2882 aa  569  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.6 
 
 
3073 aa  560  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.37 
 
 
1985 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  30.11 
 
 
2368 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  29.71 
 
 
1963 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.9 
 
 
1981 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.08 
 
 
1976 aa  450  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.71 
 
 
1928 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  29.79 
 
 
1937 aa  447  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.38 
 
 
1951 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.01 
 
 
1989 aa  446  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.35 
 
 
1987 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.54 
 
 
1989 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.86 
 
 
1998 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.78 
 
 
1981 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.82 
 
 
1979 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.12 
 
 
1985 aa  440  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.22 
 
 
1946 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  29.45 
 
 
1899 aa  432  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  28.25 
 
 
1107 aa  429  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  29.13 
 
 
1109 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  31.48 
 
 
1971 aa  423  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  29.19 
 
 
2016 aa  413  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  29.79 
 
 
1605 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  29.15 
 
 
917 aa  333  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.18 
 
 
3527 aa  317  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.77 
 
 
2477 aa  307  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  30.98 
 
 
2553 aa  306  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  27.45 
 
 
2298 aa  306  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.44 
 
 
2300 aa  301  7e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.39 
 
 
2443 aa  299  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  38.85 
 
 
1272 aa  296  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  28.79 
 
 
2674 aa  284  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  28.73 
 
 
2189 aa  282  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  27.49 
 
 
1772 aa  278  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  40.47 
 
 
2448 aa  278  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  37.9 
 
 
1764 aa  275  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  27.8 
 
 
2503 aa  271  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 
2620 aa  270  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  28.89 
 
 
2266 aa  269  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.87 
 
 
2661 aa  269  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.73 
 
 
2260 aa  264  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  34.89 
 
 
2531 aa  263  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  35.37 
 
 
453 aa  263  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  36.42 
 
 
453 aa  262  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.07 
 
 
2249 aa  260  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  38.53 
 
 
1413 aa  258  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  34.39 
 
 
2624 aa  258  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  34.35 
 
 
2619 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.33 
 
 
2694 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  34.39 
 
 
2657 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  34.39 
 
 
2640 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  39.53 
 
 
2338 aa  256  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  33.33 
 
 
2642 aa  256  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  33.12 
 
 
2693 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.12 
 
 
2704 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  33.12 
 
 
2703 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.69 
 
 
2750 aa  255  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  33.83 
 
 
2683 aa  254  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  36.97 
 
 
2560 aa  254  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  36.3 
 
 
2542 aa  254  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 
3243 aa  253  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  33.76 
 
 
2764 aa  253  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  38.27 
 
 
3115 aa  252  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  33.92 
 
 
2664 aa  251  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  37.2 
 
 
1631 aa  249  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  28.8 
 
 
2314 aa  246  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.9 
 
 
2771 aa  246  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 
2628 aa  246  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  39.19 
 
 
1480 aa  244  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  29.81 
 
 
2386 aa  244  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 
3693 aa  244  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 
3702 aa  243  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 
3693 aa  244  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.31 
 
 
2414 aa  243  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.67 
 
 
1845 aa  242  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  29.92 
 
 
2816 aa  242  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  35.23 
 
 
2772 aa  241  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  34.65 
 
 
2501 aa  239  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  35.46 
 
 
3008 aa  238  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 
3676 aa  238  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  36.16 
 
 
2327 aa  235  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  34.28 
 
 
1696 aa  234  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.27 
 
 
3696 aa  232  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  37.92 
 
 
1453 aa  231  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  28.96 
 
 
2614 aa  229  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 
1354 aa  227  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3261  beta keto-acyl synthase  31 
 
 
2262 aa  226  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  30.49 
 
 
2137 aa  227  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  30.86 
 
 
2338 aa  226  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  31 
 
 
2258 aa  225  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  30.86 
 
 
2287 aa  225  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  30.86 
 
 
2294 aa  225  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>