More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2346 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  67.01 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.52 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  48 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  21.9 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 180 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30.08 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5848  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  24.34 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>