99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2304 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  75.84 
 
 		 286 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  69.07 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  61.81 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  63.02 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  59.72 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  54.4 
 
 		 303 aa  322  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  60 
 
 		 334 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  58.87 
 
 		 333 aa  316  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  58.94 
 
 		 266 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  60.08 
 
 		 280 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  60.31 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  57.6 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  56.32 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  58.91 
 
 		 322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  54.95 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  54.58 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  58.94 
 
 		 303 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  55.09 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  54.96 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  56.7 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  53.73 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  52.14 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  52.79 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  52.79 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  52.79 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  52.24 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  51.12 
 
 		 278 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  50.76 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  43.59 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  36.72 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  27.72 
 
 		 615 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  30.8 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.74 
 
 		 1019 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  31.23 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.11 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  29.37 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.52 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  28.76 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  31.02 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  32.39 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  27.68 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.17 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.07 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.12 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  27.17 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  29.34 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  34.34 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.62 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  29.5 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  29.5 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  29.12 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 1059 aa  62.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.91 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  29.01 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  23.7 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 1052 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.02 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  25.44 
 
 		 1044 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  25 
 
 		 803 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  24.91 
 
 		 781 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  35.53 
 
 		 988 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  28.12 
 
 		 781 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.33 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  25.46 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  26.3 
 
 		 1055 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.91 
 
 		 788 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.37 
 
 		 788 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.91 
 
 		 788 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  27.03 
 
 		 1197 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  30.47 
 
 		 1038 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 1062 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  31.14 
 
 		 984 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  32.93 
 
 		 991 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  24.51 
 
 		 1045 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  34.01 
 
 		 1054 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  30.66 
 
 		 913 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.35 
 
 		 958 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  39.19 
 
 		 886 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 1040 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  26.61 
 
 		 1101 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.59 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  29.14 
 
 		 1064 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  30.06 
 
 		 1062 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.93 
 
 		 1124 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  33.33 
 
 		 1014 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.01 
 
 		 993 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  26.67 
 
 		 783 aa  43.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1061 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 1051 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 970 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 1060 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  22.64 
 
 		 1066 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>