More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1791 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  100 
 
 
750 aa  1434    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  65.04 
 
 
697 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50.76 
 
 
699 aa  568  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  52.39 
 
 
682 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  49.02 
 
 
753 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.31 
 
 
737 aa  535  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  47.28 
 
 
780 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  48.34 
 
 
733 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  46.81 
 
 
702 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  49.2 
 
 
775 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  49.57 
 
 
714 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  49.64 
 
 
700 aa  482  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  46.84 
 
 
713 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  45.11 
 
 
699 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  48.22 
 
 
764 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  44.73 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  46.07 
 
 
777 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  43.43 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  50.14 
 
 
727 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  48.35 
 
 
714 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  45.16 
 
 
745 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  40.45 
 
 
730 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  43.7 
 
 
778 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  45 
 
 
701 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  49.11 
 
 
762 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.58 
 
 
699 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.45 
 
 
712 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.23 
 
 
709 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  43.45 
 
 
713 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.62 
 
 
812 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.03 
 
 
576 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  42.43 
 
 
704 aa  324  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.48 
 
 
674 aa  299  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.48 
 
 
674 aa  299  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.33 
 
 
674 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  52.37 
 
 
339 aa  291  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  39.37 
 
 
707 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.51 
 
 
713 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.51 
 
 
673 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  42.15 
 
 
686 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  37.74 
 
 
678 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  48.37 
 
 
358 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.95 
 
 
679 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  40.06 
 
 
708 aa  248  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.83 
 
 
743 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.17 
 
 
743 aa  239  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.74 
 
 
743 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.59 
 
 
743 aa  238  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.74 
 
 
743 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.45 
 
 
743 aa  237  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.1 
 
 
743 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.28 
 
 
743 aa  234  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.28 
 
 
743 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  36.61 
 
 
711 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.83 
 
 
743 aa  218  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  30.37 
 
 
712 aa  204  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  31.96 
 
 
747 aa  204  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30.38 
 
 
882 aa  196  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.18 
 
 
726 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  34.29 
 
 
778 aa  184  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.69 
 
 
723 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.27 
 
 
717 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.17 
 
 
719 aa  171  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.67 
 
 
740 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 
737 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  29.86 
 
 
836 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.57 
 
 
1146 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.75 
 
 
736 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  37 
 
 
974 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.61 
 
 
729 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.33 
 
 
724 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  43.96 
 
 
998 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  43.96 
 
 
998 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  43.96 
 
 
998 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.81 
 
 
723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  30 
 
 
729 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  45.79 
 
 
1001 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.69 
 
 
997 aa  137  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  28.06 
 
 
710 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  34.96 
 
 
974 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.78 
 
 
726 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.8 
 
 
981 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.22 
 
 
735 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.87 
 
 
758 aa  134  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  43.41 
 
 
1089 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  44.21 
 
 
1000 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  39.25 
 
 
1002 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  31.23 
 
 
704 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.66 
 
 
1077 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  50.96 
 
 
1013 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  29.23 
 
 
860 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  26.45 
 
 
934 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.77 
 
 
741 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.85 
 
 
743 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  33.47 
 
 
955 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.93 
 
 
740 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  33.47 
 
 
955 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  33.47 
 
 
955 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  29.52 
 
 
737 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.77 
 
 
740 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>