276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1814 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1814  Outer membrane protein (porin)-like protein  100 
 
 		 354 aa  706    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000274803  hitchhiker  0.000000000255936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  36.13 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  39.06 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2561  porin  25.65 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000690644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  26.76 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.21 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1947  hypothetical protein  24.8 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  35.09 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  27.06 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  35.04 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5937  porin  34.69 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  31.35 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  27.12 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  33.13 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  26.9 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  26.87 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  26.9 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  29.12 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  35.66 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  35.66 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  33.79 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  35.66 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  26.27 
 
 		 355 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  35.66 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  35.66 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  35.66 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  26.27 
 
 		 355 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  33.79 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  35.66 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  35.77 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  33.79 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  38.17 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.95 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  23.6 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  34.62 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  25.57 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  36.72 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  26.46 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3886  porin  33.9 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.426254  normal  0.191492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  33.33 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  23.6 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  25.5 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  30.81 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  37.12 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.77 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  37.12 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  30.41 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  27.27 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  33.58 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  31.55 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  31.55 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  37.12 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  32.12 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  27.17 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  31.55 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  30.81 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  27 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  34.86 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  27.57 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  34.19 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  26.57 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  28.18 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  26.05 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  35.16 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  24.87 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  26.24 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  31.33 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  33.58 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  32.53 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.07 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  28.18 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  33.58 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  26.24 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  33.58 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.6 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.09 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  36.36 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  30.11 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  27.68 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2481  outer membrane protein (porin)  31.64 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.587098  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  35.11 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  36.22 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  34.71 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.33 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  34.86 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  34.33 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  36.36 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  32.53 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  36.36 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  33.58 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  26.54 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  36.44 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  28.05 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  34.25 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  30.15 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.53 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  32.24 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>