30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1947 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  787    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1814  Outer membrane protein (porin)-like protein  25.08 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000274803  hitchhiker  0.000000000255936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2561  porin  25.06 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000690644  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1622  Outer membrane protein (porin)-like protein  24.05 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  25.68 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  26.49 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  27.64 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  27.64 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  27.64 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  28 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  27.64 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.05 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  32.67 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  27.11 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  23.34 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  34.06 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  22.82 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  37.29 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  27.23 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  27.35 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  28.99 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  27.78 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  30.69 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  29.44 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  27.23 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  26.92 
 
 		 383 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  30.49 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  26.89 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  26.89 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  27.98 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>